RNA–Protein interactions for RNA: YNL298W

CLA4, Transcript of Cdc42p-activated signal transducing kinase, yeast

Gene CLA4, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLA4	YNL298W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	BCH1	Q05029	724 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	RTR2	Q12378	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	EHD3	P28817	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	ARN2	P38724	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YHK8	P38776	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	IKI1	P38874	309 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	POG1	P40473	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	COS4	P43542	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	GUF1	P46943	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	TAD2	P47058	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YNR048W	P53740	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	RMI1	Q02685	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	GRX5	Q02784	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PRM15	Q03262	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	GAS3	Q03655	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MHF1	Q3E835	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	FRE2	P36033	711 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	TVP38	P36164	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	IDP2	P41939	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	SNX4	P47057	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MGA1	P53050	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CDH1	P53197	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PLB3	Q08108	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YOL019W	Q08157	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	TIM9	O74700	87 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CAP2	P13517	287 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	SPT14	P32363	452 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	ZRT1	P32804	376 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MRPL17	P36528	281 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	FMP23	P38231	175 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	HAT2	P39984	401 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	GAB1	P41733	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	GTR2	P53290	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CAF40	P53829	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	DID2	P69771	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YMC1	P32331	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CLA4	YNL298W	NAT2	P37293	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	SER2	P42941	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MST27	P53176	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CPD1	P53314	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MTM1	P53320	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PFA4	Q12006	378 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	POM33	Q12164	279 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	ACF2	Q12168	779 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	RIB3	Q99258	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	COS2	P0CX12	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	COS3	P0CX13	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	RPB8	P20436	146 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
CLA4	YNL298W	YEF1	P32622	495 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YHR035W	P38769	630 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YNL140C	P53910	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	CTF19	Q02732	369 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YDC1	Q02896	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	SWF1	Q04629	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CLA4	YNL298W	ARO7	P32178	256 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	RIB5	P38145	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YBR096W	P38256	230 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
CLA4	YNL298W	NUP49	Q02199	472 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	MAK3	Q03503	176 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	TOD6	P34219	525 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YPC1	P38298	316 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	MRH4	P53166	561 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	STP1	Q00947	519 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	MHF2	Q3E829	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	LAA1	P39526	2014 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CLA4	YNL298W	ATG22	P25568	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.3 ms