RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	YHC3	P47040	408 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YJR154W	P47181	346 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YGL114W	P53134	725 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPS16	Q02608	121 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	EKI1	Q03764	534 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NUP53	Q03790	475 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YMR254C	Q04838	102 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CDC123	Q05791	360 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DCR2	Q05924	578 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YDL218W	Q07629	317 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LDB18	Q07887	179 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YOL163W	P0CF20	169 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERD1	P16151	362 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	UTR1	P21373	530 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CDC50	P25656	391 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
SRC1	YML034W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AGP2	P38090	596 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YBR096W	P38256	230 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MNL1	P38888	796 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GAA1	P39012	614 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MET30	P39014	640 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BDH1	P39714	382 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YIL169C	P40442	995 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TMA108	P40462	946 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DIA3	P52290	468 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERV29	P53337	310 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YNR066C	P53752	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CCE1	Q03702	353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VBA1	Q04301	562 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SHH3	Q04487	196 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASR1	Q06834	288 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YPL272C	Q08984	517 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YLR046C	Q12253	270 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RDI1	Q12434	202 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RIP1	P08067	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CKA1	P15790	372 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SPO7	P18410	259 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ADH7	P25377	361 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YCL068C	P25593	260 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TCA17	P32613	152 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SNC2	P33328	115 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SHP1	P34223	423 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SKT5	P34226	696 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YHR122W	P38829	231 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DAN1	P47178	298 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AZR1	P50080	613 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ROG1	P53118	685 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YDR366C	P87287	132 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TVP18	Q04767	167 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SUE1	Q06524	206 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	FDH1	Q08911	376 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MHF2	Q3E829	80 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NUM1	Q00402	2748 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	COX2	P00410	251 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CDC7	P06243	507 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PUT4	P15380	627 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ERD2	P18414	219 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MRPL6	P32904	214 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	DTR1	P38125	572 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	VPS45	P38932	577 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	NAS2	P40555	220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	MET28	P40573	187 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRM10	P42946	383 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	CCC1	P47818	322 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	AVT4	P50944	713 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	PRM8	P53174	237 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	SHY1	P53266	389 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	ASI3	P53983	676 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	TOF2	Q02208	771 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	GAS3	Q03655	524 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	YOL131W	Q08270	108 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SRC1	YML034W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97

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