RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	PAU19	P0CE85	124 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU21	P0CE86	164 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU22	P0CE87	164 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU3	P25610	124 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	TIP20	P33891	701 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	BNA4	P38169	460 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MRP21	P38175	177 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	FMO1	P38866	432 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PFS1	P38872	237 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	CTF8	P38877	133 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MEP2	P41948	499 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	STE24	P47154	453 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MTC3	P53077	123 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YGR126W	P53274	230 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	TDA6	Q06466	467 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RDR1	Q08904	546 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	BSC1	Q12140	328 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	COX19	Q3E731	98 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RAS1	P01119	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RBK1	P25332	333 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	LDB7	P38210	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	CUE1	P38428	203 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MET30	P39014	640 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	GIP2	P40036	548 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	BNS1	P50084	137 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	DIA1	P54005	336 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	BNA5	Q05979	453 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SRF1	Q12516	437 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	NUP1	P20676	1076 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	AFT1	P22149	690 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	AFG1	P32317	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SKN1	P33336	771 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RIB5	P38145	238 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	ARP1	P38696	384 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	GPI16	P38875	610 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YEL057C	P39983	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YGR149W	P48236	432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YGR079W	P53249	370 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YAP1802	P53309	568 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RTT102	P53330	157 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YML018C	Q03730	393 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	IPK1	Q06667	281 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU23	Q07987	124 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	IRC10	Q08118	586 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PST1	Q12355	444 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU17	Q12370	124 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SAL1	D6W196	494 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	QCR7	P00128	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MSW1	P04803	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MIG1	P27705	504 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	ATS1	P31386	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SEC17	P32602	292 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YHR177W	P38867	453 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YHR210C	P38893	341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	VAC8	P39968	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PUG1	P40100	303 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	AVT7	P40501	490 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YNL184C	P53876	108 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	BSP1	Q06604	576 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	CRD1	Q07560	283 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	IES4	Q08561	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PER33	Q12144	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
CLF1	YLR117C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	ERS1	P17261	260 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	UTR5	P32630	166 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PMU1	P36069	295 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PAU24	P38155	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	ICS2	P38284	255 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	YEL028W	P39989	153 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	RMD8	P43620	662 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	FPK1	P53739	893 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	CCE1	Q03702	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	PUS5	Q06244	254 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	AAD4	Q07747	329 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CLF1	YLR117C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected

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