RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	TDA1	Q03533	586 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	YML108W	Q03759	105 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	IMA2	Q08295	589 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	3.91	□□□□□ -1.78	not detected
KTR2	YKR061W	ICT1	Q12385	394 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KTR2	YKR061W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CPR4	P25334	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MSN2	P33748	704 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ECM15	P35195	104 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	APL3	P38065	1025 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.9	□□□□□ -1.79	RIP-Chip
KTR2	YKR061W	ARP1	P38696	384 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PAC2	P39937	518 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YER189W	P40104	122 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SYG1	P40528	902 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RTS2	P40962	232 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TIS11	P47977	285 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	LST7	P53237	242 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CSN9	Q03981	162 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YLR049C	Q12110	428 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	IES3	Q12345	250 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	NPC2	Q12408	173 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RDI1	Q12434	202 aa		3.9	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TOR1	P35169	2470 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HEM2	P05373	342 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	NMT1	P14743	455 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ERD1	P16151	362 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SLY1	P22213	666 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YKL187C	P34231	750 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FMP23	P38231	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ATG12	P38316	186 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	EFM1	P38732	585 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GOS1	P38736	223 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RRG9	P40156	214 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HPM1	P40481	377 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SNM1	P40993	198 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	AIM23	P47015	356 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YIP4	P53093	235 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ALG13	P53178	202 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SWC4	P53201	476 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GPI15	P53961	229 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CWC27	Q02770	301 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PIR3	Q03180	325 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PFA5	Q03289	374 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	GRX8	Q05926	109 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YDL086W	Q07505	273 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	THI20	Q08224	551 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YOL073C	Q08232	322 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FYV7	Q12247	151 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	TPO4	Q12256	659 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RGT2	Q12300	763 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	IFM1	P25038	676 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PMT2	P31382	759 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	SPC34	P36131	295 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FLO10	P36170	1169 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	RIM2	P38127	377 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	ROT2	P38138	954 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MED8	P38304	223 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FAA2	P39518	744 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	YIL054W	P40524	105 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	AZF1	P41696	914 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	FMP32	P43557	207 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	KEG1	P43614	200 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	HMS2	P47175	358 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	UBC11	P52492	156 aa		3.88	□□□□□ -1.79
KTR2	YKR061W	MRM2	P53123	320 aa		3.88	□□□□□ -1.79

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms