RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	SRY1	P36007	326 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FRE2	P36033	711 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PMU1	P36069	295 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YBR063C	P38083	404 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MDM31	P38880	579 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CHL4	P38907	458 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FET3	P38993	636 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	HEM14	P40012	539 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MET28	P40573	187 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PAU15	P40585	124 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ATG18	P43601	500 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	IRC7	P43623	340 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GWT1	P47026	490 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TAD2	P47058	250 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPR003C	P53394	754 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YNR066C	P53752	436 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GPI15	P53961	229 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CYT2	Q00873	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GRX5	Q02784	150 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SNO1	Q03144	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CSM3	Q04659	317 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SEN15	Q04675	128 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RNH202	Q05635	350 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ATG10	Q07879	167 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RAD28	Q12021	506 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MDY2	Q12285	212 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RRI1	Q12468	440 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CTF3	Q12748	733 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ERD2	P18414	219 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	LSB5	P25369	354 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SNC2	P33328	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YPC1	P38298	316 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SPL2	P38839	148 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	HPA3	P39979	161 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SPO73	P40031	143 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FLX1	P40464	311 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YIL067C	P40514	678 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	VMA21	P41806	77 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	AIF1	P52923	378 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MDM34	P53083	459 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TIM13	P53299	105 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SAY1	P53324	424 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MEP3	P53390	489 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	VPS28	Q02767	242 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YML018C	Q03730	393 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ARA2	Q04212	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FIT1	Q04433	528 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	NAT4	Q04751	285 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ATG39	Q06159	398 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	COQ10	Q08058	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SUL2	Q12325	893 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ATG5	Q12380	294 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SLO1	Q3E784	85 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TY4B-J	P47024	1803 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SUC2	P00724	532 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PEX34	P25584	144 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	URK1	P27515	501 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	URA10	P30402	227 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SYN8	P31377	255 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MSK1	P32048	576 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SFK1	P35735	353 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ALY1	P36117	915 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	QDR3	P38227	689 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RTC2	P38279	296 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	EFM1	P38732	585 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YIL012W	P40551	113 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YJL132W	P47014	750 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	ZAP1	P47043	880 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	SDT1	P53078	280 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	FLC3	P53121	802 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	PEX31	P53203	462 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	YGR126W	P53274	230 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	NUP100	Q02629	959 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ECO1	YFR027W	DYN2	Q02647	92 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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