RNA–Protein interactions for RNA: YBR217W

ATG12, Transcript of Ubiquitin-like modifier involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG12, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	YBR217W	FRE6	Q12473	712 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MNS1	P32906	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MKS1	P34072	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MTC2	P34246	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SDS24	P38314	527 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YER121W	P40076	114 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TYW3	P53177	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SCW11	P53189	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PEF1	P53238	335 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YNR048W	P53740	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	NRK1	P53915	240 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	HHT1	P61830	136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
ATG12	YBR217W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	NEJ1	Q06148	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	FRE3	Q08905	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	GEP5	Q12393	293 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	COX9	P07255	59 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MET3	P08536	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	NCA3	P46955	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SBH2	P52871	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YGL204C	P53089	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YDC1	Q02896	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	DLT1	Q04216	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	HEM25	Q07534	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	FSH3	Q99369	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPL39	P04650	51 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SIR2	P06700	562 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	HNM1	P19807	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	AHC2	P25649	128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	DOA4	P32571	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	REC114	P32841	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MTH1	P35198	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RCN1	P36054	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	FAT1	P38225	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	CTR2	P38865	189 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	DDI1	P40087	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YGL159W	P53110	370 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MTL1	P53214	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RNH201	P53942	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ATG17	Q06410	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SNA4	Q07549	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RTR2	Q12378	196 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SAG1	P20840	650 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PAU2	P32612	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PPZ2	P33329	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ZRT3	P34240	503 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SFK1	P35735	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YHL044W	P38727	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PCL6	P40038	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YIR020C	P40575	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	AVT4	P50944	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PMT5	P52867	743 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	POP6	P53218	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	IMO32	P53219	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	SLI1	P53304	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RFU1	Q08003	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	FRE8	Q12209	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	GCN4	P03069	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YML003W	P0CF16	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	AFG1	P32317	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	MTC7	P32633	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YND1	P40009	630 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATG12	YBR217W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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