RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.83■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 GPR152Q8TDT2 470 aa18.83■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 HASPINQ8TF76 798 aa18.83■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TBC1D17Q9HA65 648 aa18.83■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FAM186AA6NE01 2351 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ZMYND10O75800 440 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PAPLNO95428 1278 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ANKRD1Q15327 319 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SPECC1Q5M775 1068 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 RTP2Q5QGT7 225 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CEP57Q86XR8 500 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NECAB1Q8N987 351 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 114.2
CS-214ENST00000548849 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 BTBD18B2RXH4 712 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ATP2B1P20020 1258 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FSHRP23945 695 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ID4P47928 161 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FOSBP53539 338 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TUSC3Q13454 348 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TMEM132AQ24JP5 1023 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 POTEGQ6S5H5 508 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NUMBLQ9Y6R0 609 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 DOCK8Q8NF50 2099 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.81■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 POTEMA6NI47 508 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ANHXE9PGG2 379 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 WNT7AO00755 349 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 HTR4Q13639 388 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 MTMR9Q96QG7 549 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TTPALQ9BTX7 342 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SNTG2Q9NY99 539 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.8■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 THP07101 528 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TRIM29Q14134 588 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PSMD5Q16401 504 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 LIN9Q5TKA1 542 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FZD8Q9H461 694 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FBXW11Q9UKB1 542 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 R4GN57 208 aa18.79■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TTLL13PA6NNM8 815 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 N4BP3O15049 544 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 KIF4AO95239 1232 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 C8AP07357 584 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 LIG1P18858 919 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NTHL1P78549 312 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ME3Q16798 604 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FAM187BQ17R55 369 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PPM1LQ5SGD2 360 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 GTF3C6Q969F1 213 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 C2orf40Q9H1Z8 148 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SEMA4AQ9H3S1 761 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PDZD7Q9H5P4 517 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 POLIQ9UNA4 740 aa18.78■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PTGESO14684 152 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 MED24O75448 989 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 RECQL4O94761 1208 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 LARGE1O95461 756 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 LMNAP02545 664 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 ANAPC15P60006 121 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 GPC5P78333 572 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 MAPK6Q16659 721 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 PARM1Q6UWI2 310 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 FGF14Q92915 247 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 NACC1Q96RE7 527 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 TUFT1Q9NNX1 390 aa18.77■□□□□ 0.6
CS-214ENST00000548849 CDH7Q9ULB5 785 aa18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms