RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXorf56Q9H5V9 222 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA8RI6L899 631 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ELF1P32519 619 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP1B1Q10567 949 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEMA3FQ13275 785 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2W6PQ8NHA6 318 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD163L1Q9NR16 1453 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITPK1Q13572 414 aa18.16■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPHS2Q9NP85 383 aa18.16■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GUCY1A2P33402 732 aa18.15■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EMSYQ7Z589 1322 aa18.15■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFT43Q96FT9 208 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAMTA2O94983 1202 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TDP2O95551 362 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.15■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 53.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BATF3Q9NR55 127 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SENP1Q9P0U3 644 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENO4A6NNW6 628 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHF2O75151 1096 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NR1I3Q14994 352 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATL2Q8NHH9 583 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GH2P01242 217 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCAR1P56945 870 aa18.15■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM154Q6P9G4 183 aa18.15■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTN2O75298 545 aa18.14■□□□□ 0.5
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM247A6NEH6 219 aa18.14■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BNIP3LO60238 219 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX9Q8N6V9 391 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35G2Q8TBE7 412 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MTA3Q9BTC8 594 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAM33Q9BZ11 813 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa18.14■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KDM1AO60341 852 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CNGA3Q16281 694 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF341Q9BYN7 854 aa18.14■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRGNP10124 158 aa18.14■□□□□ 0.49
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL10P22301 178 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC18A3Q16572 532 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC36Q1X8D7 754 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP95Q96GE4 821 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEL1LQ9UBV2 794 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRFN2Q9ULH4 789 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa18.14■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUPT3HO75486 399 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KRT4P19013 534 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALX1Q15699 326 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF135Q8IUD6 432 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HPS3Q969F9 1004 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF181Q9P0P0 153 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNA3P22001 575 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KLC1Q07866 573 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPRE2Q15555 327 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAD9BQ6WBX8 426 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R36Q96LQ0 422 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSD3Q9NYI0 1048 aa18.13■□□□□ 0.49
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