RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448332.1

CXorf40A-210, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXorf40A, Length 364 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-210ENST00000448332 EDN1P05305 212 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 KLRC2P26717 231 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 SPIRE2Q8WWL2 714 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 BICD1Q96G01 975 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 MARCH5Q9NX47 278 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 MIOSQ9NXC5 875 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 MTMR6Q9Y217 621 aa20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 TADA2AO75478 443 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ZBTB33Q86T24 672 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 RAD54LQ92698 747 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 VN1R3Q9BXE9 311 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.15■□□□□ 0.82
CXorf40A-210ENST00000448332 K7ENM7 598 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ADH1AP07327 375 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ALADP13716 330 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 GRIN1Q05586 938 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 FUT10Q6P4F1 479 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 REEP2Q9BRK0 252 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CDT1Q9H211 546 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CD320Q9NPF0 282 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MUC3AQ02505 3323 aa20.14■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MCF2P10911 925 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 GRM5P41594 1212 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 OSTNP61366 133 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CREMQ03060 361 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ITIH3Q06033 890 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 KCNC3Q14003 757 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MCM6Q14566 821 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 STK38Q15208 465 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 PTPAQ15257 358 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MYCT1Q8N699 235 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 HASPINQ8TF76 798 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 PARVGQ9HBI0 331 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 STK17AQ9UEE5 414 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 DPP7Q9UHL4 492 aa20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 PTGESO14684 152 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 EPCAMP16422 314 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SCP2P22307 547 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 USP41Q3LFD5 358 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SPECC1Q5M775 1068 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 RABGGTAQ92696 567 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 USP28Q96RU2 1077 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 F8W810 466 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 DCXO43602 365 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 TOM1L1O75674 476 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ABCD1P33897 745 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 MTHFRP42898 656 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 LIG4P49917 911 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ZPBP2Q6X784 338 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 EPSTI1Q96J88 318 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 FBXL18Q96ME1 805 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 ACAP3Q96P50 834 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa20.11■□□□□ 0.81
CXorf40A-210ENST00000448332 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms