RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295314.8

TMOD4-201, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD4, Length 1,267 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-201ENST00000295314 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 STK17AQ9UEE5 414 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 GDAQ9Y2T3 454 aa13.04□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 MYO7AQ13402 2215 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 TADA2AO75478 443 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 TOM1L1O75674 476 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 MCF2P10911 925 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 KCNC3Q14003 757 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF568Q3ZCX4 644 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 ZPBP2Q6X784 338 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 SV2BQ7L1I2 683 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 GJD3Q8N144 294 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 KCNN1Q92952 543 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 ZHX3Q9H4I2 956 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 MUC3AQ02505 3323 aa13.03□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 KIAA1671Q9BY89 1806 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.02□□□□□ -0.32
TMOD4-201ENST00000295314 SPTLC2O15270 562 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CLDN3O15551 220 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 TRAK2O60296 914 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 PPP6R2O75170 966 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 URODP06132 367 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 KLRC2P26717 231 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 GRM5P41594 1212 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ZNF131P52739 623 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 NCKAP1LP55160 1127 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 PTPN14Q15678 1187 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ATL3Q6DD88 541 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ANKRD54Q6NXT1 300 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 LLGL2Q6P1M3 1020 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 USP49Q70CQ1 688 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 HAUS6Q7Z4H7 955 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ZBTB33Q86T24 672 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 AUTS2Q8WXX7 1259 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 BICD1Q96G01 975 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ACAP3Q96P50 834 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CDT1Q9H211 546 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 MARCH5Q9NX47 278 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ADAM28Q9UKQ2 775 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa13.02□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 PTGESO14684 152 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 YEATS4O95619 227 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 BRD1O95696 1058 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 F13A1P00488 732 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 PROZP22891 400 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 GLUD2P49448 558 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 OSTNP61366 133 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 USP41Q3LFD5 358 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 GPR65Q8IYL9 337 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 VN1R2Q8NFZ6 395 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 LRRC15Q8TF66 581 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 UROC1Q96N76 676 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 VN1R3Q9BXE9 311 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CHST7Q9NS84 486 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 SLC38A7Q9NVC3 462 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 DPP7Q9UHL4 492 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CFAP45Q9UL16 551 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.01□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 CASTOR2A6NHX0 329 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 K7ENM7 598 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 LILRB3O75022 631 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 EFEMP2O95967 443 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ADH1AP07327 375 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 STAT6P42226 847 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 LIG4P49917 911 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 RBM10P98175 930 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 DSG1Q02413 1049 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ZP2Q05996 745 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ITIH3Q06033 890 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 MCL1Q07820 350 aa13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13□□□□□ -0.33
TMOD4-201ENST00000295314 KYAT1Q16773 422 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms