RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253968.10

BARX1-201, Transcript of BARX homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BARX1, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1-201ENST00000253968 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 RNF39Q9H2S5 420 aa28.35■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 EXOC3O60645 756 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 ITGA4P13612 1032 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 TNFSF9P41273 254 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 ADAM9Q13443 819 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 NPAS4Q8IUM7 802 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CRIPAKQ8N1N5 446 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa28.34■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 MEIS3P2A8K0S8 358 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CLTAP09496 248 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 AKAP5P24588 427 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 C9orf50Q5SZB4 431 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 LRSAM1Q6UWE0 723 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 EEF2KMTQ96G04 330 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 FBXL18Q96ME1 805 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 LRFN2Q9ULH4 789 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 PTPRSQ13332 1948 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 RECQL4O94761 1208 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 AGMOQ6ZNB7 445 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 LRRC55Q6ZSA7 311 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 ACAP3Q96P50 834 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 KIAA1586Q9HCI6 787 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 PARP2Q9UGN5 583 aa28.33■■■□□ 2.13
BARX1-201ENST00000253968 CETN3O15182 167 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ZNF445P59923 1031 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SHHQ15465 462 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RASIP1Q5U651 963 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CEP135Q66GS9 1140 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CBWD2Q8IUF1 395 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TOP1MTQ969P6 601 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.32■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CITO14578 2027 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 UPP2O95045 317 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CXCL8P10145 99 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CASP4P49662 377 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RDH13Q8NBN7 331 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa28.31■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 BPIFA3Q9BQP9 254 aa28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RSAD1Q9HA92 442 aa28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 UBN1Q9NPG3 1134 aa28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 GIT1Q9Y2X7 761 aa28.3■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ZNF233A6NK53 670 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 AKAP3O75969 853 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 FGFR1P11362 822 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ZNF165P49910 485 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 BRSK2Q8IWQ3 736 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CEP63Q96MT8 703 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SLC9A7Q96T83 725 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TSPY26PQ9H489 355 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RNF19AQ9NV58 838 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 KLK14Q9P0G3 267 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa28.29■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ADRB2P07550 413 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 BMP8BP34820 402 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 MLH1P40692 756 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CLLU1OSQ5K130 101 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SPATA1Q5VX52 437 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SNX27Q96L92 541 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 HOXA2O43364 376 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 MYL5Q02045 173 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 HELQQ8TDG4 1101 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ZFP42Q96MM3 310 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.28■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ANK1P16157 1881 aa28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 TTC26A0AVF1 554 aa28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ARL5CA6NH57 179 aa28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 CAVIN2O95810 425 aa28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
BARX1-201ENST00000253968 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms