RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 VCX3BQ9H321 246 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 VCX3AQ9NNX9 186 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa22.68■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 GGPS1O95749 300 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ETS2P15036 469 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 MESDQ14696 234 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 WHRNQ9P202 907 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CLIC2O15247 247 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 EDF1O60869 148 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PSMG1O95456 288 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 NEK3P51956 506 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ARSHQ5FYA8 562 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PPFIBP2Q8ND30 876 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 COA7Q96BR5 231 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 UBA5Q9GZZ9 404 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 DNAJC18Q9H819 358 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 GALNT8Q9NY28 637 aa22.67■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 LYNP07948 512 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31D3P0C874 917 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PRDX5P30044 214 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 AP1B1Q10567 949 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 GPR88Q9GZN0 384 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 KRT82Q9NSB4 513 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 MAP3K7O43318 606 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 TOM1O60784 492 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 TCEA3O75764 348 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 C12orf60Q5U649 245 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 C11orf63Q6NUN7 778 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 STK33Q9BYT3 514 aa22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 NR3C1P04150 777 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 FAM163BP0C2L3 166 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ITGA8P53708 1063 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 WDR60Q8WVS4 1066 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PIGBQ92521 554 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 NUP98P52948 1817 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 EXOC3O60645 756 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 NCSTNQ92542 709 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 SFR1Q86XK3 245 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.65■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 COL4A1P02462 1669 aa22.64■■□□□ 1.22
ODC1-201ENST00000234111 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 RTP1P59025 263 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 C9orf72Q96LT7 481 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 NPHS2Q9NP85 383 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 JAG2Q9Y219 1238 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 LRRN2O75325 713 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 RFC4P35249 363 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 VPS41P49754 854 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SPARCL1Q14515 664 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 STMN2Q93045 179 aa22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 GSC2O15499 205 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ADCY7P51828 1080 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 UBE2SQ16763 222 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SNF8Q96H20 258 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 BTBD10Q9BSF8 475 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 EURLQ9NYK6 297 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ASTN1O14525 1302 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ESYT2A0FGR8 921 aa22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
ODC1-201ENST00000234111 CCDC22O60826 627 aa22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms