RNA–Protein interactions for RNA: YPL253C

VIK1, Transcript of Protein that forms a kinesin-14 heterodimeric motor with Kar3p, yeast

Gene VIK1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	YPL253C	PEP8	P40335	379 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	INA22	P40576	216 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GDS1	P41913	522 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YGL185C	P53100	379 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	OKP1	P53298	406 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	NUP49	Q02199	472 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ECM18	Q04623	453 aa		0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	STF1	P01098	86 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SSO2	P39926	295 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	UBC13	P52490	153 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YPL039W	Q03080	316 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YLR297W	Q05899	129 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	VAC14	Q06708	880 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MDY2	Q12285	212 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YPR1	Q12458	312 aa		0.37	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PUT1	P09368	476 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GPI12	P23797	304 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PET18	P25362	215 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	AEP1	P32493	518 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SFC1	P33303	322 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YKL063C	P35725	167 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	POP8	P38208	133 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PHO89	P38361	574 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SPT8	P38915	602 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ASR1	Q06834	288 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	APC9	Q12107	265 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YOR114W	Q12219	294 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	UGA1	P17649	471 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	CSM1	P25651	190 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ERG2	P32352	222 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	COT1	P32798	439 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YKR045C	P36138	183 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	PEX31	P53203	462 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	VOA1	P53262	265 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	DAD3	P69850	94 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	DPP1	Q05521	289 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ARV1	Q06541	321 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	POM33	Q12164	279 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SIA1	Q12212	622 aa		0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.36	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ATP6	P00854	259 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPC25	P35718	212 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YKL070W	P36087	169 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPC37	P36121	282 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	HIS2	P38635	335 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RRF1	P38771	230 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	VPS45	P38932	577 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SEN34	P39707	275 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SER33	P40510	469 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	AGP3	P43548	558 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	FMP33	P46998	180 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SWC4	P53201	476 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SPO19	Q03029	223 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	VBA1	Q04301	562 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MGR3	Q04472	501 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RRG8	Q06109	277 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YPR064W	Q12492	139 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	IZH4	Q99393	312 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	UBR2	Q07963	1872 aa		0.35	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	COS2	P0CX12	379 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	COS3	P0CX13	379 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	POF1	P25576	258 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	MRPL40	P36534	297 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	HMT1	P38074	348 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	ARN2	P38724	620 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GLE2	P40066	365 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	CIS3	P47001	227 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	COX16	P47081	118 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	IBA57	P47158	497 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	GTO1	P48239	356 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	NBP35	P52920	328 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	LSB1	P53281	241 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	CPD1	P53314	239 aa		0.34	□□□□□ -2.35
VIK1	YPL253C	YPL077C	Q02831	240 aa		0.34	□□□□□ -2.35

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