RNA–Protein interactions for RNA: YML125C

PGA3, Transcript of Putative cytochrome b5 reductase, localized to the plasma membrane, yeast

Gene PGA3, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PGA3	YML125C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PMT5	P52867	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRH4	P53166	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ASI3	P53983	676 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SUR7	P54003	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TDA1	Q03533	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SSY1	Q03770	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	AIM36	Q03798	255 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	DAL4	Q04895	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRX8	Q05473	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TMS1	Q12116	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SFG1	Q12507	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRP10	O75012	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	QCR7	P00128	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	GCN4	P03069	281 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CDC9	P04819	755 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HIS3	P06633	220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ADH7	P25377	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ERG9	P29704	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PAU2	P32612	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CCZ1	P38273	704 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MBA1	P38300	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MIT1	P40002	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RTT105	P40063	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SLS1	P42900	643 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YGL260W	P53056	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YGL204C	P53089	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PET191	Q02772	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MCH4	Q08268	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SOD2	P00447	233 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SPO7	P18410	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ERG4	P25340	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PTC6	P25646	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SPT10	P35208	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SFK1	P35735	353 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SDS24	P38314	527 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SLZ1	P40167	298 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ATG18	P43601	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YJR120W	P47157	116 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	DOC1	P53068	250 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RSM28	Q03430	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	GAS2	Q06135	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SSK1	Q07084	712 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RCN2	Q12044	265 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SCEI	P03882	235 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	DBF2	P22204	572 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SPT14	P32363	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TIR3	P40552	269 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YJL055W	P47044	245 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	IRC18	P47056	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPN14	P53196	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PCP1	P53259	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MTM1	P53320	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ERV29	P53337	310 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SAM50	P53969	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YLR152C	P54072	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRP51	Q02950	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PLB2	Q03674	706 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SPR28	Q04921	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	COQ11	Q05892	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ASR1	Q06834	288 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ATG41	Q12048	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RTN2	Q12443	393 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
PGA3	YML125C	RRI1	Q12468	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PRB1	P09232	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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