RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SEN34	P39707	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PUG1	P40100	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YJR120W	P47157	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MDM30	Q05930	598 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TFC7	Q12415	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	IFM1	P25038	676 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	COS9	P36034	407 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VPS52	P39904	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	OSW5	P40219	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YIL060W	P40519	144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	NNT1	Q05874	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ATG10	Q07879	167 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MMT2	Q08970	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CDC7	P06243	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HIP1	P06775	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	GPI12	P23797	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MSK1	P32048	576 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YBL010C	P32788	280 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VAM7	P32912	316 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CHK1	P38147	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ALG3	P38179	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ECM34	P38728	170 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TRR2	P38816	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YNL195C	P40168	261 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	AVT7	P40501	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	EMC5	P40540	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SLS1	P42900	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HNT2	P49775	206 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MTM1	P53320	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MRPL22	P53881	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CTF19	Q02732	369 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	LEE1	Q02799	301 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	DGK1	Q12382	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	GAL1	P04385	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	NAM2	P11325	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TIM12	P32830	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	GPX1	P36014	167 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	YKL071W	P36086	256 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	SMK1	P41808	388 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	AGX1	P43567	385 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	YHC3	P47040	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	YGR042W	P53227	271 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	REC102	Q02721	264 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	DFG16	Q99234	619 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	URA6	P15700	204 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	MGR1	P25573	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	PBN1	P25580	416 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	BUB3	P26449	341 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	SIP1	P32578	815 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SSZ1	YHR064C	PPZ2	P33329	710 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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