RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DCN1	Q12395	269 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PCL9	Q12477	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PRM4	Q12498	284 aa		3.18	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	REP1	P03871	373 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	POF1	P25576	258 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	QRI5	P32344	111 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SPO23	P33757	523 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YKL187C	P34231	750 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	BMT2	P38278	337 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	AIM23	P47015	356 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	UBC13	P52490	153 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MAL13	P53338	473 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TAF9	Q05027	157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YOR114W	Q12219	294 aa		3.17	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	DEP1	P31385	405 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SOK1	P40317	901 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	GAB1	P41733	394 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	GDS1	P41913	522 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	NUP57	P48837	541 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MGA1	P53050	456 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	ECM11	Q04110	302 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	YET2	Q04210	160 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	MFG1	Q07684	458 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	IES4	Q08561	116 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	HMS1	Q12398	434 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.16	□□□□□ -1.9
NEM1	YHR004C	HEM4	P06174	275 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YCR102C	P25608	368 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	JEN1	P36035	616 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SEO1	P39709	593 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YER184C	P39961	794 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	KRE29	P40026	464 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	BMT5	P40493	336 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YIL029C	P40538	142 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	BRR6	P53062	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PEX31	P53203	462 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GTR2	P53290	341 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MTM1	P53320	366 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YIP3	P53633	176 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPR098C	Q06089	161 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SEC10	Q06245	871 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	ARR2	Q06597	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	EAF3	Q12432	401 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.15	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SPT3	P06844	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	JLP2	P40206	208 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	HAC1	P41546	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CIN2	P46670	268 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NIF3	P53081	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	COG7	P53195	279 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GAS2	Q06135	555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YDL109C	Q12103	647 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPN6	Q12377	434 aa		3.14	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	EHD3	P28817	500 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PHA2	P32452	334 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPC1	P38298	316 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	WSC4	P38739	605 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YJR056C	P47115	236 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPS5	P53057	165 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YNL140C	P53910	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TRM82	Q03774	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	DPP1	Q05521	289 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YDL114W	Q07530	308 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	STH1	P32597	1359 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PUT1	P09368	476 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91

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