RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	LOT6	Q07923	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	YRM1	Q12340	786 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RCK1	YGL158W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RCK1	YGL158W	STF2	P16965	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	YSR3	P23501	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	HSP30	P25619	332 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	URA10	P30402	227 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	COS9	P36034	407 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	DTR1	P38125	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	BNA6	P43619	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	GLG2	P47011	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	RMR1	P53060	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	GAL83	Q04739	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	COA4	Q05809	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	FAR10	Q06001	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	GMC2	Q06201	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	CTS2	Q06350	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	RGT2	Q12300	763 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RCK1	YGL158W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	PEX34	P25584	144 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	MEI4	P29467	408 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	MSN4	P33749	630 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SER33	P40510	469 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YIL029C	P40538	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SNZ3	P43545	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	TIM21	P53220	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SNZ2	P53824	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	NSL1	Q12143	216 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	COX2	P00410	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ATP6	P00854	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	CLG1	P35190	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YBR241C	P38142	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YBR242W	P38331	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	PRM9	P39551	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SLM1	P40485	686 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	NCA3	P46955	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	LCB3	P47013	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	MNT4	P53745	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	WSC2	P53832	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	BSC6	Q08280	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	APC9	Q12107	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	EAF3	Q12432	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	PCL9	Q12477	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	CWP1	P28319	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	AGA1	P32323	725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	NUP2	P32499	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	DOA4	P32571	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ZRT1	P32804	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ECM8	P38246	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	CYC2	P38909	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	KRE29	P40026	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YRB2	P40517	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YAR1	P46683	200 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ASG7	P46993	209 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	MED11	Q99278	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SUA5	P32579	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SKG1	P36169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	AVT5	P38176	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	ATG12	P38316	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YER085C	P40058	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	FMC1	P40491	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YFL067W	P43537	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	COS10	P52924	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YNL095C	P53932	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	TDA1	Q03533	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	PEX10	Q05568	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SRL1	Q08673	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	CYC3	P06182	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	MEI5	P32489	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	SPO23	P33757	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YHR035W	P38769	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	AVT2	P39981	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YIL054W	P40524	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	DFG10	P40526	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YGR210C	P42942	411 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	HCH1	P53834	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YNL033W	P53964	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YNL019C	P53975	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RCK1	YGL158W	DDC1	Q08949	612 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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