RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRT1	YBL048W	YLL007C	Q07799	665 aa		0.94	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	DAL80	P26343	269 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	KRE6	P32486	720 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	COT1	P32798	439 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	POP8	P38208	133 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	not detected
RRT1	YBL048W	VPS45	P38932	577 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	TPN1	P53099	579 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	COG7	P53195	279 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	RSM27	P53305	110 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	TVP15	Q03860	143 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	BCP1	Q06338	283 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	GPN3	Q06543	272 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YLR413W	Q06689	675 aa		0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	GAL7	P08431	366 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YSR3	P23501	404 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	PHO89	P38361	574 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	RPE1	P46969	238 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	IBA57	P47158	497 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	PEX31	P53203	462 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	CPD1	P53314	239 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	VPS60	Q03390	229 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	VBA1	Q04301	562 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	TAF9	Q05027	157 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	SPO77	Q06134	477 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ATG5	Q12380	294 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	FMP16	Q12497	93 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		0.92	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ERG2	P32352	222 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YKL070W	P36087	169 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	RRF1	P38771	230 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	FMP33	P46998	180 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	MRX5	P47007	382 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	MND1	P53102	219 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	SFH1	Q06168	426 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	SEC10	Q06245	871 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	LOA1	Q06508	300 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.91	□□□□□ -2.26
RRT1	YBL048W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	POF1	P25576	258 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PEX3	P28795	441 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ARN2	P38724	620 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SPL2	P38839	148 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PEX18	P38855	283 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SUR2	P38992	349 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	OST3	P48439	350 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COS6	P53344	381 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CDC14	Q00684	551 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SPP2	Q02521	185 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SDC1	Q03323	175 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YOL019W	Q08157	551 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YOS9	Q99220	542 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COY1	P34237	679 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CSG2	P35206	410 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	HMT1	P38074	348 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.89	□□□□□ -2.27	not detected
RRT1	YBL048W	YHI9	P38765	294 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	COA1	P40452	197 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	SER33	P40510	469 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	LSB1	P53281	241 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CTS2	Q06350	511 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	ARV1	Q06541	321 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	CTR3	Q06686	241 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	PER33	Q12144	273 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	EMC6	Q12431	108 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	AGC1	Q12482	902 aa		0.89	□□□□□ -2.27
RRT1	YBL048W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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