RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425753.6

TSTA3-201, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSTA3, Length 1,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-201ENST00000425753 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TTC3P53804 2025 aa22.31■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 A0A1W2PPC1 479 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TISP43B9A030 160 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 FAM189A1O60320 539 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NPTXRO95502 500 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 GARTP22102 1010 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PRCPP42785 496 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ADSSL1Q8N142 457 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 BIN1O00499 593 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PDXKO00764 312 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 STAG3L1P0CL83 205 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TCHPQ9BT92 498 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.29■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 GJB5O95377 273 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 GRM5P41594 1212 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PGBD4Q96DM1 585 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 COL4A6Q14031 1691 aa22.28■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 OGTO15294 1046 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 INPPL1O15357 1258 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 NFIL3Q16649 462 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 KYAT1Q16773 422 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 ISM2Q6H9L7 571 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 CENPPQ6IPU0 288 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 HACE1Q8IYU2 909 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 RNF19AQ9NV58 838 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 PTPRSQ13332 1948 aa22.27■■□□□ 1.16
TSTA3-201ENST00000425753 HOXA2O43364 376 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 STIM1Q13586 685 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 MYBPC2Q14324 1141 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 ZBTB33Q86T24 672 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CEP120Q8N960 986 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 MLKLQ8NB16 471 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 POMGNT1Q8WZA1 660 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 HES2Q9Y543 173 aa22.26■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 PSMA7O14818 248 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 DGKIO75912 1065 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 NLRP12P59046 1061 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 FBXL18Q96ME1 805 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 RNF39Q9H2S5 420 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 ITGA4P13612 1032 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 RSAD1Q9HA92 442 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 DMAC2Q9NW81 257 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 SNTG2Q9NY99 539 aa22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 RECQL4O94761 1208 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 ADRB2P07550 413 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CLTAP09496 248 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CCNE1P24864 410 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 LRRC63Q05C16 580 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 XKR4Q5GH76 650 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.24■■□□□ 1.15
TSTA3-201ENST00000425753 LPPQ93052 612 aa22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms