RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W TY1A-LR4P0C2I8 440 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-DR6P0CX70 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-ER1P0CX71 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-LR2P0CX72 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-PLP0CX73 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-JR1P0CX74 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-LR3P0CX75 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-ML2P0CX76 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SLY41P22215 453 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SIP1P32578 815 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W APD1P38281 316 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W LNP1P38878 278 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W PHO90P39535 881 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W PZF1P39933 429 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YNL195CP40168 261 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YIL166CP40445 542 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SYS1P41544 203 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W VPS68Q12016 184 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-GR1Q12085 440 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TFC7Q12415 435 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YJR112W-AQ3E743 109 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-PR3Q6Q5H1 440 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-OLQ92392 440 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W STT4P37297 1900 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SED4P25365 1065 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SDS24P38314 527 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W PUG1P40100 303 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TYW3P53177 273 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W VPS62P53285 467 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MDM30Q05930 598 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YPD1Q07688 167 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W AIM6Q07716 390 aa9.41□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W CHO1P08456 276 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W VMA5P31412 392 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YBL010CP32788 280 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YOR062CP36025 268 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W KAE1P36132 386 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SEN34P39707 275 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W GIP2P40036 548 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W NSE4P43124 402 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MTO1P53070 669 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W OKP1P53298 406 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MRPL22P53881 309 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YPR091CQ06833 770 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ATG10Q07879 167 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YOR365CQ08844 703 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YPR063CQ12160 140 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W BMT6Q12291 365 aa9.4□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MDM35O60200 86 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W NAM2P11325 894 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CDC34P14682 295 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W NPR1P22211 790 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MSK1P32048 576 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YIL060WP40519 144 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W EMC5P40540 141 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W IDP2P41939 412 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W LYS20P48570 428 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YGL117WP53133 265 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YCL001W-AP87012 153 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SNO1Q03144 224 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MMT2Q08970 484 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YLR422WQ06409 1932 aa9.39□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RPS31P05759 152 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W COS9P36034 407 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W OMA1P36163 345 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TRM7P38238 310 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W ERV15P38312 142 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W OCA5P38738 679 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W VPS52P39904 641 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W OTU1P43558 301 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CCC1P47818 322 aa9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W BER1Q06688 274 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YFR010W-AP0C5N0 62 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W OAR1P35731 278 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CHK1P38147 527 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W VBA2P38358 474 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W DED81P38707 554 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W SLS1P42900 643 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W QRI1P43123 477 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CIN2P46670 268 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W LYS5P50113 272 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W PNC1P53184 216 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CTF19Q02732 369 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W INH1P01097 85 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W YPK2P18961 677 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W CPR4P25334 318 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W MDL1P33310 695 aa9.37□□□□□ -0.91
PRP4YPR178W ATG8P38182 117 aaRIP-Chip data9.37□□□□□ -0.91not detected
PRP4YPR178W AVT7P40501 490 aa9.37□□□□□ -0.91
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