RNA–Protein interactions for RNA: YPR036W

VMA13, Transcript of Subunit H of the V1 peripheral membrane domain of V-ATPase, yeast

Gene VMA13, Length 1,437 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA13	YPR036W	CCE1	Q03702	353 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SYO1	Q07395	620 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ATG10	Q07879	167 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	THP1	Q08231	455 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PEX27	Q08580	376 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YPR096C	O13587	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	QCR7	P00128	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	HTB2	P02294	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	AI3	P03877	415 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MRPL6	P32904	214 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YKL063C	P35725	167 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ECM8	P38246	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MIC12	P38341	106 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YHR122W	P38829	231 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	FET3	P38993	636 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YER184C	P39961	794 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ERG28	P40030	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	GIP2	P40036	548 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	JLP2	P40206	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MPM1	P40364	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YKE4	P40544	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MDV1	P47025	714 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	NBP35	P52920	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	IMO32	P53219	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	IGO1	P53897	168 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YNL140C	P53910	189 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MTQ1	P53944	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	REC102	Q02721	264 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ASM4	Q05166	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YOR365C	Q08844	703 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RRI1	Q12468	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MRP10	O75012	95 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	TPK3	P05986	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ALG7	P07286	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YPK3	P38070	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	LNP1	P38878	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SRP14	P38985	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	FYV6	P53913	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ROT1	Q03691	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PNS1	Q12412	539 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	DCG1	P32460	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YKL097C	P34245	136 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PTC7	P38797	343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	GGC1	P38988	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	COG3	P40094	801 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YNL195C	P40168	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YNL194C	P40169	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	MSE1	P48525	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	PKP2	P53170	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	ZRG17	P53735	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	GOR1	P53839	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YAT1	P80235	687 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SWP1	Q02795	286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SSY1	Q03770	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RIM13	Q03792	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	TPP1	Q03796	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	SWF1	Q04629	336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	FMP42	Q04991	504 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	POS5	Q06892	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	POM34	Q12445	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	YPR1	Q12458	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RIB3	Q99258	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
VMA13	YPR036W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
VMA13	YPR036W	NDC1	P32500	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TAF14	P35189	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	STP2	P38704	541 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	GPI16	P38875	610 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	KRE29	P40026	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	FAR7	P43592	221 aa		4.96	□□□□□ -1.62
VMA13	YPR036W	TAX4	P47030	604 aa		4.96	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.7 ms