RNA–Protein interactions for RNA: YOR259C

RPT4, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT4, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT4	YOR259C	DOA4	P32571	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RML2	P32611	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YJL068C	P40363	299 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BMT5	P40493	336 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MOG1	P47123	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YJR120W	P47157	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	COQ5	P49017	307 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PHB2	P50085	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FYV6	P53913	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YPL113C	Q02961	396 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	VPS68	Q12016	184 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	QCR7	P00128	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	INH1	P01097	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	HOM3	P10869	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SEC12	P11655	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	LDS1	P31379	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PAU2	P32612	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ORC2	P32833	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PEX32	P38292	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	AXL2	P38928	823 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PHO23	P50947	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	HHO1	P53551	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ODC1	Q03028	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CRR1	Q05790	422 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GAS2	Q06135	555 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	KEI1	Q06346	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TPO4	Q12256	659 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FRE6	Q12473	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YLR358C	O13565	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CAN1	P04817	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YCL002C	P25565	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ATS1	P31386	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YMC1	P32331	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SIP1	P32578	815 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SUA5	P32579	426 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PPG1	P32838	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ECT1	P33412	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FLO10	P36170	1169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CDS1	P38221	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GGC1	P38988	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	APQ12	P40532	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PRM10	P42946	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	NSE4	P43124	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YFR020W	P43600	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	UBX6	P47049	396 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	COS12	P53053	380 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SGF73	P53165	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YGR042W	P53227	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RXT3	Q07458	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	REX4	Q08237	289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SCP1	Q08873	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BTS1	Q12051	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	DGK1	Q12382	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	TRM13	Q12383	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FSH3	Q99369	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	SEC22	P22214	214 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	GPI12	P23797	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YCR100C	P25606	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	YBL010C	P32788	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	KKQ8	P36004	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	BNA4	P38169	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RRN10	P38204	145 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPT4	YOR259C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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