RNA–Protein interactions for RNA: YHR064C

SSZ1, Transcript of Hsp70 protein that interacts with Zuo1p (a DnaJ homolog), yeast

Gene SSZ1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSZ1	YHR064C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ZRC1	P20107	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BOS1	P25385	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CWH43	P25618	953 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MCM10	P32354	571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MKK2	P32491	506 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
SSZ1	YHR064C	YIL166C	P40445	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	POG1	P40473	351 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VHT1	P53241	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VPS62	P53285	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FYV6	P53913	173 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YPD1	Q07688	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	GRC3	Q07845	632 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TMA17	Q12513	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	GAL4	P04386	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PHO2	P07269	559 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CHO1	P08456	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PRB1	P09232	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YCL002C	P25565	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CNE1	P27825	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	OAR1	P35731	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YOR062C	P36025	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MAL32	P38158	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	LNP1	P38878	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
SSZ1	YHR064C	GIP2	P40036	548 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SFH5	P47008	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	UBX6	P47049	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	IBA57	P47158	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VEL1	P53058	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YGL159W	P53110	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MAL12	P53341	584 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PNG1	Q02890	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ROT1	Q03691	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BNA7	Q04066	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TMN2	Q04562	672 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YEH1	Q07804	573 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	THI73	Q07904	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	GLO4	Q12320	285 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	EAF3	Q12432	401 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	STT4	P37297	1900 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RPD3	P32561	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CDS1	P38221	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	IDP2	P41939	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MOG1	P47123	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MCM22	P47167	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CCC1	P47818	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	BUL1	P48524	976 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TOS2	P50078	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SGF73	P53165	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YGR026W	P53217	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	OKP1	P53298	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RSM27	P53305	110 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	AIM6	Q07716	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	KIN28	P06242	306 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CPR4	P25334	318 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MRPL37	P36532	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	MRPL16	P38064	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PEX32	P38292	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ERV15	P38312	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SDS24	P38314	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	PHO90	P39535	881 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	RMD6	P39975	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	NEO1	P40527	1151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	CDH1	P53197	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SNO4	Q04902	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	HSP32	Q08992	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	ISN1	Q99312	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SEC22	P22214	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SED4	P25365	1065 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	OMA1	P36163	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SSZ1	YHR064C	SHG1	P38337	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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