RNA–Protein interactions for RNA: RDN25-1

RDN25-1, Transcript of 25S ribosomal RNA (25S rRNA), yeastyeast

Gene RDN25-1, Length 3,396 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDN25-1RDN25-1 YMR087WQ04299 284 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-1RDN25-1 YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RDN25-1RDN25-1 YPR114WQ06107 315 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-1RDN25-1 MRL1Q06815 381 aa8.9□□□□□ -0.98
RDN25-1RDN25-1 ISC1P40015 477 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 AVT4P50944 713 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MPA43P53583 542 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YDR366CP87287 132 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PLB2Q03674 706 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YML083CQ04526 418 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 FDH1Q08911 376 aa8.9□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SSN3P39073 555 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SLS1P42900 643 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ADO1P47143 340 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TPO3Q06451 622 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RRT8Q08219 342 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TMS1Q12116 473 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MRX4Q12467 430 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MEX67Q99257 599 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SNF6P18888 332 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SUA5P32579 426 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SNC2P33328 115 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RAS1P01119 309 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 DTR1P38125 572 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 BDH1P39714 382 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PRM10P42946 383 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YAE1P47118 141 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YSA1Q01976 231 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 CCE1Q03702 353 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RIM13Q03792 727 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SHH3Q04487 196 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 CRT10Q08226 957 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YPQ1Q12010 308 aa8.89□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 CDC50P25656 391 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TIP1P27654 210 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TCD2P36101 447 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ZTA1P38230 334 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 BUD17P53727 317 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 HTS1P07263 546 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ZRC1P20107 442 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 LAC1P28496 418 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ASC1P38011 319 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YAR1P46683 200 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PRY3P47033 881 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MDM34P53083 459 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YDC1Q02896 317 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MSS11Q03825 758 aa8.88□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PRE1P22141 198 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SGE1P33335 543 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RTC2P38279 296 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 IGO1P53897 168 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ANT1Q06497 328 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RTN2Q12443 393 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 CKA1P15790 372 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YBR220CP38318 560 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SKO1Q02100 647 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 CTK1Q03957 528 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PUN1Q06991 263 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TGS1Q12052 315 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 ARE1P25628 610 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SNM1P40993 198 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 AIM25P47140 327 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SGF73P53165 657 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YGR079WP53249 370 aa8.87□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SDH4P37298 181 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PUS4P48567 403 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 KXD1P53158 218 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YGR015CP53208 328 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MEP3P53390 489 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YDR524C-BQ3E6R4 66 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SPO7P18410 259 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data8.86□□□□□ -0.99not detected
RDN25-1RDN25-1 HTD2P38790 280 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YHR177WP38867 453 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YPL272CQ08984 517 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TFC7Q12415 435 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 COX2P00410 251 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YIL108WP40483 696 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SDT1P53078 280 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TEN1Q07921 160 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 LEU9Q12166 604 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 AIM45Q12480 344 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YLR099W-AQ3E798 87 aa8.86□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 GCV3P39726 170 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 BUD9P53226 547 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data8.85□□□□□ -0.99not detected
RDN25-1RDN25-1 YMR130WQ04223 302 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 TVP18Q04767 167 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 PRE3P38624 215 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YIL165CP40446 119 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MET28P40573 187 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 INP53Q12271 1107 aa8.85□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 MKK1P32490 508 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SFC1P33303 322 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 BNA4P38169 460 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 SHE1P38200 338 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 STS1P38637 319 aa8.84□□□□□ -0.99
RDN25-1RDN25-1 YHR210CP38893 341 aa8.84□□□□□ -0.99
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