RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000189048.6

Tardbp-223, Transcript of TAR DNA-binding protein 43, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Tardbp, Length 1,096 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tlr9	Q9EQU3	1032 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rab27a	Q9ERI2	221 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Scly	Q9JLI6	432 aa		5.06	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ambra1	A2AH22	1300 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kif16b	B1AVY7	1312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tbkbp1	A2A9T0	611 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ajap1	A2ALI5	412 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Izumo3	A6PWV3	263 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm8994	E9PV04	411 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tspan15	F7BWT7	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aamp	J3QN89	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hsd3b6	O35469	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Akap10	O88845	662 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gja4	P28235	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nrl	P54846	237 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nhlh1	Q02576	133 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	F13b	Q07968	669 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	4930480E11Rik	Q0VG34	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aifm3	Q3TY86	605 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zscan4f	Q3URS2	506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cp	Q61147	1061 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fnip1	Q68FD7	1165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hdac10	Q6P3E7	666 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tbata	Q7TSD4	393 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sh3tc2	Q80VA5	1289 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zscan4c	Q80VJ6	506 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Smoc1	Q8BLY1	463 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Spata32	Q8C5V0	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sh3d19	Q91X43	789 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Prpf6	Q91YR7	941 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Plscr2	Q9DCW2	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Spint2	Q9WU03	252 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Col5a2	Q3U962	1497 aa		5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ep400	Q8CHI8	3072 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gsto1	O09131	240 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ascl2	O35885	263 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fmr1	P35922	614 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tst	P52196	297 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sparcl1	P70663	650 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Trappc9	Q3U0M1	1148 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Adrbk2	Q3UYH7	688 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Usp17la	Q61068	526 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fxr1	Q61584	677 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zranb3	Q6NZP1	1069 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pigv	Q7TPN3	493 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Elac2	Q80Y81	831 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Uba6	Q8C7R4	1053 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cpz	Q8R4V4	654 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Lmcd1	Q8VEE1	365 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tardbp	Q921F2	414 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Pdgfd	Q925I7	370 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Sesn3	Q9CYP7	492 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Bag3	Q9JLV1	577 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dnajb12	Q9QYI4	376 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Irs4	Q9Z0Y7	1216 aa		5.04	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Htt	P42859	3119 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Mtcl1	Q3UHU5	1945 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fanci	Q8K368	1330 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Map7d2	A2AG50	781 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zfp942	B8JJA7	486 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Smpd5	D6MZJ6	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm10647	E9Q8X0	124 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kcnc1	P15388	511 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Anapc15	P60007	132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hspa8	P63017	646 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Hmgb1	P63158	215 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nfic	P70255	439 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Aplp2	Q06335	707 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	PRAG1	Q571I4	1179 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Znf385b	Q8BXJ8	482 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ctxn3	Q8BXZ0	80 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Trim52	Q8CDV4	233 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cc2d1a	Q8K1A6	943 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Nat10	Q8K224	1024 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rnf146	Q9CZW6	359 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Duoxa2	Q9D311	320 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cmip	Q9D486	773 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Arrdc2	Q9D668	407 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cyp27a1	Q9DBG1	533 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Jph3	Q9ET77	744 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Tas2r105	Q9JKT4	300 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slamf1	Q9QUM4	343 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cd97	Q9Z0M6	818 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ly6g6d	Q9Z1Q3	135 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Ccl27	Q9Z1X0	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Col15a1	O35206	1367 aa		5.03	□□□□□ -1.6
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm17949	A0A1B0GRV7	212 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Veph1	A1A535	833 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zmynd8	A2A484	1235 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Dnajc25	A2ALW5	357 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Fam46d	B1ATX6	390 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Gm10036	E9PYL9	178 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Zbtb10	E9Q8X5	861 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Kpna6	O35345	536 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Slc16a2	O70324	545 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Rundc1	Q0VDN7	615 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Cpne7	Q0VE82	557 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Perm1	Q149B8	807 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	Klrg2	Q3UM83	387 aa		5.02	□□□□□ -1.61
Tardbp-223	ENSMUST00000189048	1810065E05Rik	Q5NC41	235 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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