RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)K

tK(UUU)K, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)K, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)KtK(UUU)K GSH1P32477 678 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SSE2P32590 693 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.88□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K SRP102P36057 244 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K AIM3P38266 947 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YBR138CP38277 524 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YLF2P38746 405 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RPP1P38786 293 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MTC6P38849 526 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K CHL4P38907 458 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ECM1P39715 212 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K BUR6P40096 142 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YNL195CP40168 261 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MDJ2P42834 146 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K STB1P42845 420 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YFL066CP43538 392 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K IRC7P43623 340 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K FMP33P46998 180 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YJL055WP47044 245 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RMR1P53060 241 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K BRR6P53062 197 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ERP6P53198 216 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K DAM1P53267 343 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SYF2P53277 215 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RRN9P53437 365 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YNL165WP53891 406 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K COG5P53951 403 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RSM23Q01163 450 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K HOT1Q03213 719 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K GPI17Q04080 534 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YDL114WQ07530 308 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SRL2Q12020 392 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K TGS1Q12052 315 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SIA1Q12212 622 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K TAF3Q12297 353 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K IZH2Q12442 317 aa2.88□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SPS4P09937 338 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K APA2P22108 325 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ERG4P25340 473 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SED4P25365 1065 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K UBC8P28263 218 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K TCA17P32613 152 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K CLB6P32943 380 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SSZ1P38788 538 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ARO9P38840 513 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MDM31P38880 579 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MSS4P38994 779 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YER084WP40057 128 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K AAD14P42884 376 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SWP82P43554 623 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K LOH1P47055 219 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SLI1P53304 468 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MTM1P53320 366 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K DMA2P53924 522 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K CRZ1P53968 678 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RSM28Q03430 361 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RSM24Q03976 319 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YDR391CQ04170 232 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K TAZ1Q06510 381 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YPR196WQ06595 470 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K IPK1Q06667 281 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SWA2Q06677 668 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YPR097WQ06839 1073 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K HRT1Q08273 121 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K THI72Q08579 599 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K FRE3Q08905 711 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YDL176WQ12027 708 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K USB1Q12208 290 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K GEP5Q12393 293 aa2.87□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data2.87□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.86□□□□□ -1.95not detected
tK(UUU)KtK(UUU)K REP1P03871 373 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RPL6BP05739 176 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MET3P08536 511 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K PDA1P16387 420 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K HNM1P19807 563 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K PPA2P28239 310 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K OAC1P32332 324 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K VPH2P32341 215 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K PRP21P32524 280 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K SUR1P33300 382 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ECT1P33412 323 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YKL187CP34231 750 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K YKL107WP34251 309 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K ANR2P36090 516 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K OSH7P38755 437 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K RRG9P40156 214 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K GAT2P40209 560 aa2.86□□□□□ -1.95
tK(UUU)KtK(UUU)K QDR1P40475 563 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 34.9 ms