RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)G

tF(GAA)G, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)G, Length 73 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)GtF(GAA)G RSC9Q03124 581 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G INP1Q03694 420 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR102CQ03864 110 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR387CQ04162 555 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR114CQ04597 100 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G ERV41Q04651 352 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G DAL4Q04895 635 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SPO77Q06134 477 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MDM36Q06820 579 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G PUN1Q06991 263 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G TMA16Q08687 178 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SWT1Q12104 458 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MSH5Q12175 901 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G FCY1Q12178 158 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HOS1Q12214 470 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YHR214C-EQ8TGK0 99 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YMR105W-AQ8TGS8 64 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G TDH2P00358 332 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MSS18P08593 268 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR034C-AP0C289 58 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G RAP1P11938 827 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G RRP43P25359 394 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G APL1P27351 700 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC65P29478 273 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G CAM1P29547 415 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MSK1P32048 576 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HXT1P32465 570 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G ISC10P32645 267 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G TRS65P32893 560 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G ADH5P38113 351 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G VMA22P38784 181 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HAT2P39984 401 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SCS2P40075 244 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YER137CP40083 148 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G BUR6P40096 142 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G VPS27P40343 622 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC9P40357 651 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G XPT1P47165 209 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HMS2P47175 358 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G GTO1P48239 356 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDL183CP48569 320 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G PRP31P49704 494 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G TYW3P53177 273 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YNL140CP53910 189 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G ERG5P54781 538 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G LGE1Q02796 332 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NRG1Q03125 231 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SCS7Q03529 384 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G URC2Q04411 772 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HLR1Q04429 423 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SWF1Q04629 336 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YDR222WQ04925 415 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G GMC2Q06201 188 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G BRE4Q07660 1125 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G THI72Q08579 599 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MCP1Q12106 302 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NMD4Q12129 218 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MCT1Q12283 360 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NPC2Q12408 173 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YOR343CQ12484 108 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YLR307C-AQ3E825 87 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G TAR1Q8TGM6 124 aa0.44□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MRP10O75012 95 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G CBP2P03874 630 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G ADE8P04161 214 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G CHO1P08456 276 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G DSF1P0CX08 502 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YNR073CP0CX09 502 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HEM15P16622 393 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G STF2P16965 84 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SPO16P17122 198 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G DBP3P20447 523 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G HXT2P23585 541 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G BMH1P29311 267 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G THI4P32318 326 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NUP2P32499 720 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SMI1P32566 505 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SIP1P32578 815 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G RAD23P32628 398 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G CBF5P33322 483 aaKnown RBP RIP-Chip data0.43□□□□□ -2.34not detected
tF(GAA)GtF(GAA)G KES1P35844 434 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NCL1P38205 684 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G IST2P38250 946 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G RFC5P38251 354 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SMF2P38778 549 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G PTC7P38797 343 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G CCT2P39076 527 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SOP4P39543 234 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G AIM10P39965 576 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G RMD6P39975 231 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G NOP16P40007 231 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G KRE29P40026 464 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G MRX1P40050 688 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G SEC26P41810 973 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G GCD10P41814 478 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G QRI7P43122 407 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G PTR3P43606 678 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G PIR5P46999 287 aa0.43□□□□□ -2.34
tF(GAA)GtF(GAA)G YJR120WP47157 116 aa0.43□□□□□ -2.34
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