RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YJU3P28321 313 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W MCM10P32354 571 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
PRP4YPR178W DCW1P36091 449 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ALG3P38179 458 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data9.47□□□□□ -0.89not detected
PRP4YPR178W SRB7P47822 140 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W FLC3P53121 802 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ARG5,6Q01217 863 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W ROY1Q04847 553 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W PUS9Q12069 462 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W YDL211CQ12121 372 aa9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W RPS21BQ3E754 87 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRP4YPR178W SSA3P09435 649 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RPB5P20434 215 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SSH4P32343 579 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W FLO10P36170 1169 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W CDS1P38221 457 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SMB1P40018 196 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YJR111CP47148 283 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RSM7P47150 247 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W GIM3P53900 129 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ROT1Q03691 256 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W FDH1Q08911 376 aa9.46□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W GAL1P04385 528 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ADE1P27616 306 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SHM2P37291 469 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W PRS3P38689 320 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W POG1P40473 351 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SFH5P47008 294 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SSN8P47821 323 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SAM37P50110 327 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RSM27P53305 110 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YPR109WQ06104 294 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W XYL2Q07993 356 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W DGK1Q12382 290 aa9.45□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-DR4O74302 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-AP0CX57 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-PR1P0CX58 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-ORP0CX59 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-PR2P0CX60 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-DR5P0CX65 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-ER2P0CX66 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-GR3P0CX67 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-LR1P0CX68 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-MR2P0CX69 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W FUR1P18562 216 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ERG1P32476 496 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RPD3P32561 433 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W BET3P36149 193 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MAL32P38158 584 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RGA1P39083 1007 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-JR2P47099 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W BUL1P48524 976 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YGL235WP53071 178 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YGL204CP53089 101 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ART5P53244 586 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W MAL12P53341 584 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-DR1Q03856 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TAZ1Q06510 381 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-BRQ12217 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-NL2Q12470 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TY1A-GR2Q12485 440 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W DET1Q99288 334 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W Q0142Q9ZZW4 58 aa9.44□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TDH2P00358 332 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YKR104WP0CE69 306 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W GPI12P23797 304 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W PEX32P38292 413 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YPC1P38298 316 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W IMD2P38697 523 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ECM34P38728 170 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W RMD6P39975 231 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W NEO1P40527 1151 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YHC3P47040 408 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W FOL2P51601 243 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W ERG26P53199 349 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YGR042WP53227 271 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W FMP41P53889 259 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W TMN2Q04562 672 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SNO4Q04902 237 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W CRR1Q05790 422 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YOR378WQ08902 515 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W HSP32Q08992 237 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W YOR114WQ12219 294 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W CMC2Q3E7A4 109 aa9.43□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W GAL4P04386 881 aa9.42□□□□□ -0.9
PRP4YPR178W HIP1P06775 603 aa9.42□□□□□ -0.9
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