RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	YNL260C	P53846	198 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PPN1	Q04119	674 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RSF1	Q05043	376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CNL1	Q06333	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	THI72	Q08579	599 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	COA6	Q3E846	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SUC2	P00724	532 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SGA1	P08019	549 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TRK2	P28584	889 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MET22	P32179	357 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CHL4	P38907	458 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PNT1	P38969	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PET130	P47065	347 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL095C	P53932	642 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL033W	P53964	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL019C	P53975	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	UPS3	Q04006	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR413W	Q06689	675 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YET3	Q07451	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RKI1	Q12189	258 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	JLP1	Q12358	412 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MHF1	Q3E835	90 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CDC9	P04819	755 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SRB5	P32585	307 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PEX2	P32800	271 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TIP20	P33891	701 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YKR051W	P36142	418 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	DTR1	P38125	572 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SWM2	P40342	146 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	LTP1	P40347	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	POG1	P40473	351 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	LCB2	P40970	561 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	VMA21	P41806	77 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SAM37	P50110	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SKG3	Q06315	1026 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CDD1	Q06549	142 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATG5	Q12380	294 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CDC4	P07834	779 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SAC7	P17121	654 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	STE50	P25344	346 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PHD1	P36093	366 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	DAD2	P36162	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YBR241C	P38142	488 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YBR096W	P38256	230 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	DBP8	P38719	431 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TAT2	P38967	592 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PUG1	P40100	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PRM2	P40534	656 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SNM1	P40993	198 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SHR5	P41912	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YJR149W	P47177	404 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SKP1	P52286	194 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MKC7	P53379	596 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YIP3	P53633	176 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	UGO1	Q03327	502 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RNH202	Q05635	350 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TEN1	Q07921	160 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CSI2	Q08054	341 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AIM39	Q08223	395 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GPM3	Q12326	303 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TRM13	Q12383	476 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MSN1	P22148	382 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TIM23	P32897	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SNC2	P33328	115 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ADD66	P36040	267 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	OMA1	P36163	345 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SDH4	P37298	181 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	WSC4	P38739	605 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HPA3	P39979	161 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PTR3	P43606	678 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HXT16	P47185	567 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PHB2	P50085	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERV29	P53337	310 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TIM10	P87108	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ECM9	Q02202	377 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CCE1	Q03702	353 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HSP31	Q04432	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64

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