RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	BDH2	P39713	417 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ASG7	P46993	209 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	FYV6	P53913	173 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SUC2	P00724	532 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SPS18	P32572	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YKR041W	P36134	250 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PHB2	P50085	310 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	GPI1	P53306	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MAL13	P53338	473 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ABF2	Q02486	183 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YCT1	Q12235	531 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RGT2	Q12300	763 aa		4.68	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SGE1	P33335	543 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	THI80	P35202	319 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	OXA1	P39952	402 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	UFE1	P41834	346 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	GDS1	P41913	522 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	FMP32	P43557	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YJL016W	P47072	561 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CCC1	P47818	322 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NUP57	P48837	541 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	USE1	P53146	245 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CAF40	P53829	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CCE1	Q03702	353 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	GRX8	Q05926	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MHR1	Q06630	226 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MFG1	Q07684	458 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ICT1	Q12385	394 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	BAR1	P12630	587 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	EXO70	P19658	623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PHO80	P20052	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CLB2	P24869	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	VPS52	P39904	641 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	IRC18	P47056	224 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YJR012C	P47087	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CDH1	P53197	566 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	COG5	P53951	403 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CTR3	Q06686	241 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SIR4	P11978	1358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	NUP1	P20676	1076 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	COX13	P32799	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CSG2	P35206	410 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CBP4	P37267	147 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YBR096W	P38256	230 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RBG1	P39729	369 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YER076C	P40049	302 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HMS2	P47175	358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MST27	P53176	234 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	PCP1	P53259	346 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	HEM25	Q07534	307 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	BBP1	Q12365	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SNT2	P53127	1403 aa		4.66	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CPR4	P25334	318 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	ROT2	P38138	954 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	WSC4	P38739	605 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YHR035W	P38769	630 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	CPR8	P53728	308 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	DYN2	Q02647	92 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	TMA10	Q06177	86 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	RDI1	Q12434	202 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.65	□□□□□ -1.66
HOF1	YMR032W	SAL1	D6W196	494 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	CSM2	P40465	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	TRM9	P49957	279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	BRR6	P53062	197 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	ASI3	P53983	676 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YLR152C	P54072	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	GAT3	Q07928	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HOF1	YMR032W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.6 ms