RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ISU1	Q03020	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MCP1	Q12106	302 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RTR2	Q12378	196 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	HIS3	P06633	220 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GSH1	P32477	678 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ECM34	P38728	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YFL051C	P43552	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NIT2	P47016	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DCI1	Q08558	271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GRE1	Q08969	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TSC13	Q99190	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SIR3	P06701	978 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PRB1	P09232	635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SAM35	P14693	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.6	□□□□□ -1.67	not detected
NDC1	YML031W	DIT1	P21623	536 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SCO1	P23833	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ATG22	P25568	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	THI4	P32318	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRPS5	P33759	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NIC96	P34077	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YHR180W	P38868	163 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YTA6	P40328	754 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	IDP2	P41939	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RET2	P43621	546 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	IRC18	P47056	224 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SNX4	P47057	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GNP1	P48813	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	LYS5	P50113	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DLT1	Q04216	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SIA1	Q12212	622 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YDL180W	Q12301	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ATG31	Q12421	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PDE2	P06776	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TFS1	P14306	219 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YCK1	P23291	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YKL187C	P34231	750 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	BIG1	P38813	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MTC6	P38849	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RRG9	P40156	214 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NTA1	P40354	457 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DML1	Q03652	475 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	COQ11	Q05892	277 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ARV1	Q06541	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	URA3	P03962	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MOD5	P07884	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RNP1	P32385	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DTR1	P38125	572 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MBA1	P38300	278 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SKN7	P38889	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MLH1	P38920	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MDE1	P47095	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TOS2	P50078	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MTQ1	P53944	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DID2	P69771	204 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ACS1	Q01574	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PHO92	Q06390	306 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YNG1	Q08465	219 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ENV7	Q12003	364 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DYN1	P36022	4092 aa		4.59	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	RER1	P25560	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	CHK1	P38147	527 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PHM8	P40025	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	HXT9	P40885	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	GDS1	P41913	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	TPN1	P53099	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	PCP1	P53259	346 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NDC1	YML031W	YGR126W	P53274	230 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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