RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RPO31	P04051	1460 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	FLO11	P08640	1367 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YKL187C	P34231	750 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MID2	P36027	376 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MCH2	P36032	473 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	VPS45	P38932	577 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	GDS1	P41913	522 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YNL050C	P53952	270 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	INP2	Q03824	705 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	UFD4	P33202	1483 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MMS22	Q06164	1454 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	DAL5	P15365	543 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YBR062C	P38239	180 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YMR262W	P38430	313 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YFL012W	P43580	148 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YNL260C	P53846	198 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YMR244W	Q04018	355 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	IZH4	Q99393	312 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YOR1	P53049	1477 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	MLP2	P40457	1679 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	CSM1	P25651	190 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	GPX1	P36014	167 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YKL070W	P36087	169 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	RTT105	P40063	208 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	GTO1	P48239	356 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	UBC13	P52490	153 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	SWC4	P53201	476 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	FMP48	P53233	369 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YNR066C	P53752	436 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	INP1	Q03694	420 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	VTI1	Q04338	217 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RPC17	YJL011C	AUS1	Q08409	1394 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.27	□□□□□ -1.89	not detected
RPC17	YJL011C	ATP6	P00854	259 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	INO2	P26798	304 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RIB7	P33312	244 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YER184C	P39961	794 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	COQ5	P49017	307 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	MND1	P53102	219 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YLR446W	Q06204	433 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YDL012C	Q12489	107 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FMP16	Q12497	93 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	COX10	P21592	462 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ZRT3	P34240	503 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RPC37	P36121	282 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	PEX18	P38855	283 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	YGR067C	P53243	804 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ECM11	Q04110	302 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	GMC1	Q04399	608 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	BCP1	Q06338	283 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	LAG2	Q92325	660 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	CHD1	P32657	1468 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	OM45	P16547	393 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	UFE1	P41834	346 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	AGP3	P43548	558 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FMP33	P46998	180 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	FLC3	P53121	802 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	ECM19	Q06011	112 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	3.25	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	RPB9	P27999	122 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RPC17	YJL011C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.24	□□□□□ -1.89

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