RNA–Protein interactions for RNA: YIL039W

TED1, Transcript of Conserved phosphoesterase domain-containing protein, yeast

Gene TED1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TED1	YIL039W	YHI9	P38765	294 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RAD17	P48581	401 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	AIF1	P52923	378 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	KTR6	P54070	446 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ECM18	Q04623	453 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	MSC3	Q05812	728 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	NDE2	Q07500	545 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	LDB17	Q12342	491 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	MSI1	P13712	422 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PCL1	P24867	279 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	BUD2	P33314	1104 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YUH1	P35127	236 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	WSS1	P38838	269 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YIL089W	P40500	205 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PMT5	P52867	743 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	TDA1	Q03533	586 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	CSN9	Q03981	162 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RRT8	Q08219	342 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	DDC1	Q08949	612 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	MER1	P16523	270 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	AEP1	P32493	518 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YHK8	P38776	514 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	MIG3	P39943	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YEL028W	P39989	153 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	GAB1	P41733	394 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	FMP32	P43557	207 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PEX31	P53203	462 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	TIM13	P53299	105 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.57	□□□□□ -1.84	not detected
TED1	YIL039W	SPC2	Q04969	178 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	NSE1	Q07913	336 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	GET4	Q12125	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	EAF3	Q12432	401 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	GAL7	P08431	366 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	VPH2	P32341	215 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	NUP2	P32499	720 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YEF1	P32622	495 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	COX13	P32799	129 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	DRE2	P36152	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YHR182W	P38870	785 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SNL1	P40548	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	EGT2	P42835	1041 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	AIM24	P47127	394 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	BIR1	P47134	954 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	AQR1	P53943	586 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SPR6	Q01684	191 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ABZ2	Q03266	374 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	DYN3	Q04949	312 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SEC10	Q06245	871 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YPL247C	Q12523	523 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	COX5A	P00424	153 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SNF4	P12904	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	UTH1	P36135	365 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	RTC2	P38279	296 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	PRM9	P39551	298 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SEO1	P39709	593 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	STE24	P47154	453 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	EFM3	P47163	339 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	GET1	P53192	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	YNL143C	P53908	130 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	HAL1	Q01766	294 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	TSA2	Q04120	196 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SMP3	Q04174	516 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	ATG17	Q06410	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SWC7	Q06707	132 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TED1	YIL039W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.2 ms