RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	SCM3	Q12334	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	ACH1	P32316	526 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PAU2	P32612	120 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	MRPL16	P38064	232 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	FET3	P38993	636 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	VOA1	P53262	265 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	DCR2	Q05924	578 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	AIM6	Q07716	390 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YLR125W	Q12138	136 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	KIN28	P06242	306 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	HIS3	P06633	220 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YJL193W	P39542	402 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PLB2	Q03674	706 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	HNT3	Q08702	217 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	BAG7	Q12128	409 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	COX1	P00401	534 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	GCN4	P03069	281 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	HYM1	P32464	399 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	KRE6	P32486	720 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	EMP70	P32802	667 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.67	□□□□□ -0.22	not detected
RTC3	YHR087W	MTH1	P35198	433 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YMR252C	Q04814	134 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	RDR1	Q08904	546 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	CLG1	P35190	452 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YHR210C	P38893	341 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	CCC1	P47818	322 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	ATG41	Q12048	136 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	HSP42	Q12329	375 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PET54	P10834	293 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	BOS1	P25385	244 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YHR180W	P38868	163 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	MSS4	P38994	779 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PAM16	P42949	149 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	SNO3	P43544	222 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YJR115W	P47152	169 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YGL204C	P53089	101 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	CUZ1	P53899	274 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YPR109W	Q06104	294 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	FRE7	Q12333	620 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	GPM1	P00950	247 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SFK1	P35735	353 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SAY1	P53324	424 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YMR130W	Q04223	302 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	HRT1	Q08273	121 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	BTS1	Q12051	335 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	CDC9	P04819	755 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	HPA3	P39979	161 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	POP1	P41812	875 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YFR054C	P43622	192 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	DOC1	P53068	250 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	MRPL13	Q02204	264 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	MRPS16	Q02608	121 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SEI1	Q06058	285 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RPB8	P20436	146 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	ITR1	P30605	584 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	HSP150	P32478	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	PEX32	P38292	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YBR242W	P38331	238 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SSY1	Q03770	852 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	AIM36	Q03798	255 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SNX41	Q04053	625 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SSK1	Q07084	712 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YOR343C	Q12484	108 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	EHD3	P28817	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YKR073C	P36153	106 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	BAP3	P41815	604 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SUR7	P54003	302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	IRC19	Q07843	230 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YOR378W	Q08902	515 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	STF2	P16965	84 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	STE50	P25344	346 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	PPQ1	P32945	549 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	AAD14	P42884	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	YDR249C	Q03787	373 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23

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