RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C MFG1Q07684 458 aa5.78□□□□□ -1.48
SHO1YER118C YOR114WQ12219 294 aa5.78□□□□□ -1.48
SHO1YER118C RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
SHO1YER118C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SHO1YER118C YLR111WQ12528 110 aa5.78□□□□□ -1.48
SHO1YER118C TPI1P00942 248 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RAD5P32849 1169 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C NTF2P33331 125 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SRP102P36057 244 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C APD1P38281 316 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C MET30P39014 640 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C DFG10P40526 253 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C CIN2P46670 268 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ALG13P53178 202 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ARK1P53974 638 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YLR460CP54007 376 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C TRM44Q02648 567 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YDC1Q02896 317 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C DIG1Q03063 452 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YMR027WQ04371 470 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PRM6Q04705 352 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C TPO3Q06451 622 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C DDC1Q08949 612 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YPR064WQ12492 139 aa5.77□□□□□ -1.49
SHO1YER118C REP1P03871 373 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PUT1P09368 476 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C HCM1P25364 564 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C CHA1P25379 360 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C TRR1P29509 319 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SPT4P32914 102 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C CHK1P38147 527 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SHG1P38337 142 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C VPS52P39904 641 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ICE2P40499 491 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C IRC7P43623 340 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C VPS60Q03390 229 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C BCH1Q05029 724 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C MUM3Q08750 479 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C TAF10Q12030 206 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SNU23Q12368 194 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RPN6Q12377 434 aa5.76□□□□□ -1.49
SHO1YER118C HSL1P34244 1518 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C GIT1P25346 518 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C NUF2P33895 451 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C NDT80P38830 627 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SHC1P39000 512 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SOK1P40317 901 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C GWT1P47026 490 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C NUP57P48837 541 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C NSA1P53136 463 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PEX31P53203 462 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C VHT1P53241 593 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C GND2P53319 492 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YNL234WP53857 426 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SNO1Q03144 224 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YMR206WQ03695 313 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ECI1Q05871 280 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C TAZ1Q06510 381 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ESA1Q08649 445 aa5.75□□□□□ -1.49
SHO1YER118C CTS1P29029 562 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C JEN1P36035 616 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C MST28P39552 234 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SEO1P39709 593 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C AGE2P40529 298 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RTS2P40962 232 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YNL320WP42840 284 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YMR166CQ03829 368 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C BSC1Q12140 328 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ICT1Q12385 394 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SWR1Q05471 1514 aa5.74□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C STH1P32597 1359 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YKL075CP36083 450 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C DRE2P36152 348 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YBR096WP38256 230 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ATG12P38316 186 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C GIM4P40005 111 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C JLP2P40206 208 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C VPS25P47142 202 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C IBD2P53892 351 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C HEM25Q07534 307 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C YNG1Q08465 219 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PET20Q99373 253 aa5.73□□□□□ -1.49
SHO1YER118C SIR4P11978 1358 aa5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C BCY1P07278 416 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C PET494P07390 489 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ASP3-2P0CX77 362 aa5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ASP3-3P0CX78 362 aa5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ASP3-4P0CX79 362 aa5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ASP3-1P0CZ17 362 aa5.72□□□□□ -1.49
SHO1YER118C ZWF1P11412 505 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 39.1 ms