RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GPI15	P53961	229 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YMR155W	Q03795	547 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG39	Q06159	398 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PUS5	Q06244	254 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YOL131W	Q08270	108 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR262W	Q12331	272 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	EAF3	Q12432	401 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RRI1	Q12468	440 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SFG1	Q12507	346 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SRF1	Q12516	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	QCR2	P07257	368 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.37	□□□□□ -1.87	not detected
XRS2	YDR369C	STE4	P18851	423 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DAL82	P21705	255 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MSN2	P33748	704 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	QDR3	P38227	689 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BDH1	P39714	382 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YIL067C	P40514	678 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG18	P43601	500 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PTR3	P43606	678 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YGR117C	P53270	476 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DYN2	Q02647	92 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RSM10	Q03201	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GMC1	Q04399	608 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ECM18	Q04623	453 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PIN3	Q06449	215 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TPO3	Q06451	622 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	COQ10	Q08058	207 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BSC6	Q08280	497 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MMT2	Q08970	484 aa		3.37	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	COX2	P00410	251 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HAP4	P14064	554 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	LSB5	P25369	354 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARP1	P38696	384 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SOL3	P38858	249 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YER188W	P40103	239 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	OSW5	P40219	148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PAU15	P40585	124 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SET4	P42948	560 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	QRI7	P43122	407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TAH11	P47112	604 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YGL114W	P53134	725 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YGR035C	P53222	116 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATF2	P53296	535 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MSC2	Q03455	724 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YML018C	Q03730	393 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RGT2	Q12300	763 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	APE1	P14904	514 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MIH1	P23748	554 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RER1	P25560	188 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	COT1	P32798	439 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PMU1	P36069	295 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RIB1	P38066	345 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YHL044W	P38727	235 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MUP3	P38734	546 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CHL4	P38907	458 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FLX1	P40464	311 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	IME4	P41833	600 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MOB2	P43563	287 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AIF1	P52923	378 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GPG1	P53130	126 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ROY1	Q04847	553 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	IPK1	Q06667	281 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AIM39	Q08223	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MHF2	Q3E829	80 aa		3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CYC7	P00045	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CDC4	P07834	779 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GAL7	P08431	366 aa		3.35	□□□□□ -1.87

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