RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YNL143CP53908 130 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W VAC7P53950 1165 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SEG1Q04279 960 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W POS5Q06892 414 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YPL199CQ08954 240 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YDL109CQ12103 647 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ATP16Q12165 160 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SIA1Q12212 622 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MHT1Q12525 324 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SUS1Q6WNK7 96 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YCL012CQ8J0M4 134 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W HAP2P06774 265 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MSF1P08425 469 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MET2P08465 486 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SCH9P11792 824 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W AFG1P32317 509 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W NDC1P32500 655 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YER137CP40083 148 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W GAT1P43574 510 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PMT4P46971 762 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PRP24P49960 444 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W HER2Q03557 464 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PHO92Q06390 306 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RRT8Q08219 342 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YOR214CQ12282 236 aa5.03□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W TFS1P14306 219 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MRPL8P22353 238 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RRP7P25368 297 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YIM1P28625 365 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W ERG9P29704 444 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W OAC1P32332 324 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W HYM1P32464 399 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W CAT2P32796 670 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W TIP20P33891 701 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RSM22P36056 628 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W BNA4P38169 460 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YBR137WP38276 179 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SBE22P38814 852 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MDM31P38880 579 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W NVJ1P38881 321 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W CFD1P40558 293 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MDV1P47025 714 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W HMS2P47175 358 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RPS12P48589 143 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W PKP2P53170 491 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W ZRG17P53735 605 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SKO1Q02100 647 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SNZ1Q03148 297 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SPO77Q06134 477 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YLR446WQ06204 433 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YLR012CQ07927 99 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YOR365CQ08844 703 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W CRC1Q12289 327 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W PST1Q12355 444 aa5.02□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W STE3P06783 470 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
VHS1YDR247W SNC1P31109 117 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MSN2P33748 704 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W THI2P38141 450 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W TCM62P38228 572 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data5.01□□□□□ -1.61not detected
VHS1YDR247W TVP23P38962 199 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W ERG10P41338 398 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W GDS1P41913 522 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W STE24P47154 453 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W NBP35P52920 328 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RRN9P53437 365 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W LSM7P53905 115 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MRPS16Q02608 121 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W PEX25Q02969 394 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YMR087WQ04299 284 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W VPS74Q06385 345 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RRP9Q06506 573 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SSK1Q07084 712 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YLR031WQ07978 186 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MRX4Q12467 430 aa5.01□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SLH1P53327 1967 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RAD52P06778 471 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SPS2P08459 502 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YAR066WP0CX18 203 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YHR214WP0CX19 203 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W PET54P10834 293 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W LHP1P33399 275 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W MRPL40P36534 297 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W SCO2P38072 301 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W RRP4P38792 359 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W AIM10P39965 576 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W YIL024CP40543 189 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W TIR3P40552 269 aa5□□□□□ -1.61
VHS1YDR247W UFE1P41834 346 aa5□□□□□ -1.61
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