RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C YPR204C-AP0CX98 160 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SEC12P11655 471 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C AFG1P32317 509 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YEF1P32622 495 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YKR051WP36142 418 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YBR220CP38318 560 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPP1P38786 293 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RFC4P40339 323 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SSU1P41930 458 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PHB2P50085 310 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C STR3P53101 465 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YGR168CP53293 376 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PRP38Q00723 242 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NUP49Q02199 472 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NRG1Q03125 231 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ECM18Q04623 453 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RAD34Q06665 692 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C IPK1Q06667 281 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C POM33Q12164 279 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR415CO13578 112 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C COX5BP00425 151 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ARO2P28777 376 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SKT5P34226 696 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DRE2P36152 348 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DBP8P38719 431 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YHR035WP38769 630 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPF1P38805 295 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C BDH1P39714 382 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YAR1P46683 200 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C IRC8P47046 822 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TRM9P49957 279 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C BIO3P50277 480 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DIA3P52290 468 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YGR079WP53249 370 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YAP1802P53309 568 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C BOR1P53838 576 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C LSM7P53905 115 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DIA1P54005 336 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YML018CQ03730 393 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PIN3Q06449 215 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CDD1Q06549 142 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR413WQ06689 675 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C COQ10Q08058 207 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FRE8Q12209 686 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RRI1Q12468 440 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TMA17Q12513 150 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YOL159C-AQ3E769 90 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR099W-AQ3E798 87 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YPR014CQ6B0W2 109 aa2.94□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SCH9P11792 824 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SST2P11972 698 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C REV1P12689 985 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C HAP3P13434 144 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PET18P25362 215 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PHO91P27514 894 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C AEP1P32493 518 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MRPL6P32904 214 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CLB6P32943 380 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YPC1P38298 316 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FET3P38993 636 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C MGS1P40151 587 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YIL012WP40551 113 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FKH2P41813 862 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YGL185CP53100 379 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C COQ6P53318 479 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YPR003CP53394 754 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YAT1P80235 687 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YMR130WQ04223 302 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C SHH3Q04487 196 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NAT4Q04751 285 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C IRC10Q08118 586 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C NMD4Q12129 218 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YRA1Q12159 226 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YLR126CQ12288 251 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C TFC7Q12415 435 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FKS3Q04952 1785 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C ERD2P18414 219 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RPB5P20434 215 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CKS1P20486 150 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C HEM12P32347 362 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YKR075CP36155 307 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C APT2P36973 181 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C DTR1P38125 572 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C RIM2P38127 377 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C URA8P38627 578 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C FSH1P38777 243 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CHS7P38843 316 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C CKB2P38930 258 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C GAT2P40209 560 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C YIL067CP40514 678 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C LCB2P40970 561 aa2.93□□□□□ -1.94
DOA4YDR069C PTR3P43606 678 aa2.93□□□□□ -1.94
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