RNA–Protein interactions for RNA: Q0060

AI3, Transcript of Endonuclease I-SceIII, yeast

Gene AI3, Length 1,248 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI3	Q0060	VPH2	P32341	215 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	CYM1	P32898	989 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	PRY2	P36110	329 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SMP1	P38128	452 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YPC1	P38298	316 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SCC4	P40090	624 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	NRM1	P53718	249 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	GPN3	Q06543	272 aa		2.63	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ERD1	P16151	362 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	EPT1	P22140	391 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YKL063C	P35725	167 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TAE1	P38340	232 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YER184C	P39961	794 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YAR1	P46683	200 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MRX5	P47007	382 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	KAP114	P53067	1004 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YNR066C	P53752	436 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SPP2	Q02521	185 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	INP2	Q03824	705 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	CSI1	Q04368	295 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	GMC2	Q06201	188 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ASR1	Q06834	288 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MCH1	Q07376	486 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TRM10	Q12400	293 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YPR064W	Q12492	139 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	LAG2	Q92325	660 aa		2.62	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	INO2	P26798	304 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	GPX1	P36014	167 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TPO5	P36029	618 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MRPL37	P36532	105 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	VAB2	P40003	282 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YFL012W	P43580	148 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MIC19	P43594	170 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	GMC1	Q04399	608 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YLL007C	Q07799	665 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RRT8	Q08219	342 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	VIK1	Q12045	647 aa		2.61	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	COX2	P00410	251 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TFS1	P14306	219 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	AEP1	P32493	518 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ECM34	P38728	170 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RRT13	P40042	185 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ATC1	Q04005	294 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	VBA1	Q04301	562 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YPR195C	Q06594	109 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ERP3	Q12403	225 aa		2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YSR3	P23501	404 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SUA5	P32579	426 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YUH1	P35127	236 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YBR062C	P38239	180 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TDA11	P38854	504 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	PRM9	P39551	298 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YIA6	P40556	373 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	IBA57	P47158	497 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	VEL1	P53058	206 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TPN1	P53099	579 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	LIF1	P53150	421 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	RRN5	Q02983	363 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	PEX30	Q06169	523 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	TAZ1	Q06510	381 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YOR292C	Q08743	309 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YOR114W	Q12219	294 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.59	□□□□□ -1.99
AI3	Q0060	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
AI3	Q0060	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	COY1	P34237	679 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	MBA1	P38300	278 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	UFE1	P41834	346 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	YGR067C	P53243	804 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	YML018C	Q03730	393 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	COX20	Q04935	205 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	POM33	Q12164	279 aa		2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
AI3	Q0060	MSF1	P08425	469 aa		2.57	□□□□□ -2
AI3	Q0060	RSR1	P13856	272 aa		2.57	□□□□□ -2
AI3	Q0060	DAL81	P21657	970 aa		2.57	□□□□□ -2
AI3	Q0060	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2

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