RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 NCOA4Q13772 614 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EPHA7Q15375 998 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ANO5Q75V66 913 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 OSMRQ99650 979 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C1orf112Q9NSG2 853 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 COG5Q9UP83 839 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 AKT3Q9Y243 479 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.75□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MARCH6O60337 910 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MGEA5O60502 916 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DNM2P50570 870 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 FAM228AQ86W67 206 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ADAM2Q99965 735 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHA12Q9UN75 941 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PPME1Q9Y570 386 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TTC28Q96AY4 2481 aa14.74□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TTC3P53804 2025 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DENND3A2RUS2 1198 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C9IYK1 514 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 GPC3P51654 580 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 GPM6BQ13491 265 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DSC3Q14574 896 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PTPROQ16827 1216 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 AAK1Q2M2I8 961 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MTERF2Q49AM1 385 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C4orf19Q8IY42 314 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MTMR9Q96QG7 549 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PLVAPQ9BX97 442 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MUC3AQ02505 3323 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 COL4A6Q14031 1691 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TMEM150BA6NC51 233 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SLITRK3O94933 977 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 PPP1R16BQ96T49 567 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 BMP1P13497 986 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SCTRP47872 440 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DRP2Q13474 957 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RABEP1Q15276 862 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 EML3Q32P44 896 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 HPS1Q92902 700 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C8orf76Q96K31 380 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SH2D3AQ9BRG2 576 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 RGL1Q9NZL6 768 aa14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CCDC130-211ENST00000589669 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 LYPLA2O95372 231 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 YWHABP31946 246 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CTNNB1P35222 781 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NPEPPSP55786 919 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CALCRLQ16602 461 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF410Q86VK4 478 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 P2RX5Q93086 422 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 DYDC2Q96IM9 177 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CEP170P1Q96L14 293 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 LXNQ9BS40 222 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC130-211ENST00000589669 CYLDQ9NQC7 956 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms