RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258607.9

CKAP2-201, Transcript of cytoskeleton associated protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CKAP2, Length 3,375 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2-201ENST00000258607 KRIT1O00522 736 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 FGGP02679 453 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 CAPN2P17655 700 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PTGER2P43116 358 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 DYNLT1P63172 113 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PSMD2Q13200 908 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 ZCWPW2Q504Y3 356 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 HGSNATQ68CP4 663 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 TMEM270Q6UE05 265 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 FAM83AQ86UY5 434 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SLC7A3Q8WY07 619 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SLC5A5Q92911 643 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 IFT74Q96LB3 600 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 ITIH6Q6UXX5 1313 aa9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 FAM153BP0C7A2 387 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 TNFSF9P41273 254 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 WNT7BP56706 349 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 CETN1Q12798 172 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 FAM153CQ494X1 144 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SEMA4DQ92854 862 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 KLRG1Q96E93 195 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 NAGPAQ9UK23 515 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.834e-13■■■■□ 22.4
CKAP2-201ENST00000258607 RGS20O76081 388 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 VTNP04004 478 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.833e-7■■□□□ 13.9
CKAP2-201ENST00000258607 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PSMC5P62195 406 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 STRN3Q13033 797 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 CDCA5Q96FF9 252 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 TLR10Q9BXR5 811 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 AZI2Q9H6S1 392 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 C10orf88Q9H8K7 445 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 AKT3Q9Y243 479 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PDXKO00764 312 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 B4GALT5O43286 388 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 GLI1P08151 1106 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 CFHP08603 1231 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 PIK3CAP42336 1068 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 RAP1GAPP47736 663 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF653Q96CK0 615 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 OPTNQ96CV9 577 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 SPON1Q9HCB6 807 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 CYP39A1Q9NYL5 469 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 COX16Q9P0S2 106 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 KAT6AQ92794 2004 aa9.84□□□□□ -0.83
CKAP2-201ENST00000258607 GRAP2O75791 330 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GGCXP38435 758 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KCTD2Q14681 263 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SLC18A3Q16572 532 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GNPTABQ3T906 1256 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NETO2Q8NC67 525 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ATG4AQ8WYN0 398 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SPATA33Q96N06 139 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ACCSQ96QU6 501 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 ZNF302Q9NR11 478 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SNX12Q9UMY4 172 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 HES2Q9Y543 173 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 UMODL1Q5DID0 1318 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 GRID2IPA4D2P6 1211 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 LMNB1P20700 586 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 NOVP48745 357 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 TGFB2P61812 414 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 PLCB3Q01970 1234 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MAPK7Q13164 816 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 STXBP2Q15833 593 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 KRT35Q92764 455 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SLC10A4Q96EP9 437 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CPB2Q96IY4 423 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CCDC114Q96M63 670 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 SYT17Q9BSW7 474 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 MSTO1Q9BUK6 570 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 CACNG4Q9UBN1 327 aa9.83□□□□□ -0.84
CKAP2-201ENST00000258607 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms