RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C URE2P23202 354 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C GIT1P25346 518 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C GSH1P32477 678 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C SKG1P36169 355 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C EDS1P38073 919 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C SRO77P38163 1010 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C ECM14P38836 430 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C ISC1P40015 477 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C IRC7P43623 340 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C IDS2P46958 469 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C MDE1P47095 244 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C GET1P53192 235 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C GPI1P53306 609 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C MTM1P53320 366 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C APM1Q00776 475 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C SED1Q01589 338 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C RRN5Q02983 363 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C FIT3Q08907 204 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C IZH2Q12442 317 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YPR015CQ12531 247 aa6.04□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C CCW14O13547 238 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C REP1P03871 373 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YOL162WP0CF19 215 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C PRE2P30656 287 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C GDH2P33327 1092 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data6.03□□□□□ -1.44not detected
SPE3YPR069C PEX6P33760 1030 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C HCS1P34243 683 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C PIG2P40187 538 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C VHR1P40522 640 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YIR020CP40575 100 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C EGT2P42835 1041 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YFL066CP43538 392 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C DPB11P47027 764 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C ABM1P47146 123 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C BRR6P53062 197 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C DSL1P53847 754 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C ASI1P54074 624 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C DML1Q03652 475 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YDR102CQ03864 110 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C PEX12Q04370 399 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C ATG26Q06321 1198 aa6.03□□□□□ -1.44
SPE3YPR069C YER145C-AA0A023PYF4 145 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C DPM1P14020 267 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C PRP4P20053 465 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data6.02□□□□□ -1.45not detected
SPE3YPR069C MNS1P32906 549 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C CLB6P32943 380 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C ARC19P33204 171 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YBR241CP38142 488 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YBR096WP38256 230 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YER184CP39961 794 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C QDR1P40475 563 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C NCA3P46955 337 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C PEF1P53238 335 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C TNA1P53322 534 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C SPR6Q01684 191 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C TFB3Q03290 321 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C HMO1Q03973 246 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C AGE1Q04412 482 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C SNO4Q04902 237 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C GTB1Q04924 702 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C BCP1Q06338 283 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C CTS2Q06350 511 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C GAT3Q07928 141 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C MIM1Q08176 113 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C HRT1Q08273 121 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C HSP33Q08914 237 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C HSP32Q08992 237 aa6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RDL1Q12305 139 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C PRP28P23394 588 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C SED4P25365 1065 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RPS5P26783 225 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RPB9P27999 122 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.01□□□□□ -1.45not detected
SPE3YPR069C SPT10P35208 640 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C MLH1P38920 769 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YIP5P53108 310 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YGR168CP53293 376 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YNL095CP53932 642 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YDR387CQ04162 555 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C ASA1Q06822 443 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RNH203Q12338 110 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RTR2Q12378 196 aa6.01□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C SIR3P06701 978 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RPS23BP0CX30 145 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C ERG4P25340 473 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C PPA2P28239 310 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C MRPL16P38064 232 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C SOL3P38858 249 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RBG1P39729 369 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C NAS2P40555 220 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YGL101WP53144 215 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C YNL046WP53956 172 aa6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
SPE3YPR069C FSH3Q99369 266 aa6□□□□□ -1.45
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