RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	CSM3	Q04659	317 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MET2	P08465	486 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MRPL6	P32904	214 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YFR018C	P43599	363 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TOM22	P49334	152 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RMI1	Q02685	241 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SFM1	Q12314	213 aa		0.51	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MXR2	P25566	168 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	VHT1	P53241	593 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YNR068C	P53754	272 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RGM1	Q00453	211 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CPT1	P17898	393 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MKK1	P32490	508 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MRPS5	P33759	307 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YKR015C	P36111	568 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DAD2	P36162	133 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YDR089W	P38966	869 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PES4	P39684	611 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPE1	P46969	238 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SHE4	P51534	789 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	COS1	P53822	381 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MRX4	Q12467	430 aa		0.5	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	NAS6	P50086	228 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MLC1	P53141	149 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RRN9	P53437	365 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YNL143C	P53908	130 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	VPS9	P54787	451 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YMR209C	Q03648	457 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	NNT1	Q05874	261 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	LAG2	Q92325	660 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	IZH4	Q99393	312 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CKA2	P19454	339 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	COX10	P21592	462 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CYM1	P32898	989 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SHE1	P38200	338 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RCK1	P38622	512 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TRR2	P38816	342 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MLH1	P38920	769 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	KRE29	P40026	464 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	UFE1	P41834	346 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MRS2	Q01926	470 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	GMC1	Q04399	608 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	UTR1	P21373	530 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	TKL2	P33315	681 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	FET3	P38993	636 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SLM1	P40485	686 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	KEL2	P50090	882 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RET3	P53600	189 aa		0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	DAP2	P18962	818 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SIF2	P38262	535 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	ATG12	P38316	186 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	PHO89	P38361	574 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MED6	P38782	295 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	SED5	Q01590	340 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YPL113C	Q02961	396 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	YLR297W	Q05899	129 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	MCT1	Q12283	360 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	CUP2	P15315	225 aa		0.48	□□□□□ -2.33
HAL9	YOL089C	OPI1	P21957	404 aa		0.48	□□□□□ -2.33

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