RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W UGA1P17649 471 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W ART10P18634 518 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W YMC1P32331 307 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W SIC1P38634 284 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W PCL5P38794 229 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W SLI1P53304 468 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W SAM50P53969 484 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRP51Q02950 344 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data2.58□□□□□ -2not detected
SIN3YOL004W TAF3Q12297 353 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W BPH1P25356 2167 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W CCH1P50077 2039 aa2.58□□□□□ -2
SIN3YOL004W STE3P06783 470 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W MRP1P10662 321 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RNR1P21524 888 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W COQ2P32378 372 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W SIM1P40472 476 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W NAS2P40555 220 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W BNA6P43619 295 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W GTO1P48239 356 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSC3Q05812 728 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W ULA1Q12059 462 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W GPH1P06738 902 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W MET3P08536 511 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RAP1P11938 827 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W DBP3P20447 523 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W STE14P32584 239 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W UFD1P53044 361 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YIP5P53108 310 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W MNT4P53745 580 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W HXT11P54862 567 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W REX2P54964 269 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W VPS20Q04272 221 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W AIM39Q08223 395 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W NRT1Q08485 598 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W ROX3P25046 220 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W DEP1P31385 405 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W ECM4P36156 370 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W THI2P38141 450 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W PPS1P38148 807 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W PEX32P38292 413 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W UIP3P39547 235 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W GOR1P53839 350 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YDR179W-AQ03983 463 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RXT3Q07458 294 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RLM1Q12224 676 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YPR1Q12458 312 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YCR075W-AQ3E830 75 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YCR006CP25350 157 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W YCR061WP25639 631 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W SEC66P33754 206 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W SWC5P38326 303 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W WSC4P38739 605 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W MTW1P39731 289 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W SEC9P40357 651 aa2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W RKM1Q08961 583 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
SIN3YOL004W IDH2P28241 369 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W FAA1P30624 700 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPC25P35718 212 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSG5P38590 489 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W CUZ1P53899 274 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W YPL067CQ02754 198 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W VAM3Q12241 283 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPL31BP0C2H9 113 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W COS2P0CX12 379 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W COS3P0CX13 379 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
SIN3YOL004W PTC7P38797 343 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W YNL195CP40168 261 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W COS4P43542 379 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W SDC1Q03323 175 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W REX4Q08237 289 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W UAF30Q08747 228 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W MET16P18408 261 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W MNS1P32906 549 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W ICE2P40499 491 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W YNL181WP53878 407 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W GSY2P27472 705 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W YKR015CP36111 568 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data2.56□□□□□ -2not detected
SIN3YOL004W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W TAF12Q03761 539 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W FSH3Q99369 266 aa2.56□□□□□ -2
SIN3YOL004W SOD2P00447 233 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W MSW1P04803 379 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W NAM2P11325 894 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W RVS161P25343 265 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W PBN1P25580 416 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W POP5P28005 173 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W ITR1P30605 584 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W YKL070WP36087 169 aa2.55□□□□□ -2
SIN3YOL004W ECM34P38728 170 aa2.55□□□□□ -2
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