RNA–Protein interactions for RNA: YNR042W

YNR042W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNR042W, Length 429 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNR042W	YNR042W	SHE9	Q04172	456 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	GTB1	Q04924	702 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	SML1	Q04964	104 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	PNP1	Q05788	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	DCI1	Q08558	271 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	HMS1	Q12398	434 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	RPB8	P20436	146 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	MSN1	P22148	382 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	MDL1	P33310	695 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	APL3	P38065	1025 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	SHU2	P38957	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	CHA4	P43634	648 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	FAR3	P46671	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	UFD1	P53044	361 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	BRR6	P53062	197 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	RNT1	Q02555	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	RSM24	Q03976	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	YDR387C	Q04162	555 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	COQ10	Q08058	207 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	MCM16	Q12262	181 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	MRX4	Q12467	430 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YNR042W	YNR042W	MRPS28	P21771	286 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	TCA17	P32613	152 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	RIM2	P38127	377 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YJR142W	P47173	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YML119W	Q03208	357 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	TMA10	Q06177	86 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MFG1	Q07684	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	PSR1	Q07800	427 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	VHS3	Q08438	674 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	THI72	Q08579	599 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	UAF30	Q08747	228 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ACF2	Q12168	779 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	PUT2	P07275	575 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YBR241C	P38142	488 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YBL029W	P38201	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YHR035W	P38769	630 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	BIG1	P38813	335 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	VPS41	P38959	992 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	SWD1	P39706	426 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	BUR6	P40096	142 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	FLX1	P40464	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
YNR042W	YNR042W	ASI3	P53983	676 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MSS11	Q03825	758 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MRX10	Q05648	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MCT1	Q12283	360 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	DFG16	Q99234	619 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MET3	P08536	511 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MRP13	P12686	339 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MER1	P16523	270 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	CLB3	P24870	427 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	STE14	P32584	239 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YME2	P32843	850 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	FAT1	P38225	669 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YBR096W	P38256	230 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YNL195C	P40168	261 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	SNM1	P40993	198 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	RPA43	P46669	326 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	TWF1	P53250	332 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	KRE28	Q04431	385 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	JLP1	Q12358	412 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ARG3	P05150	338 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YPK2	P18961	677 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	PRE4	P30657	266 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	TRS65	P32893	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	CCZ1	P38273	704 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	GAB1	P41733	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	AVT4	P50944	713 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	WSC2	P53832	503 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	ADH4	P10127	382 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	CMK2	P22517	447 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YNR042W	YNR042W	POL4	P25615	582 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16 ms