RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	SNF6	P18888	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	CLB2	P24869	491 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	GIT1	P25346	518 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
MRPL39	YML009C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	YBR220C	P38318	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	SIC1	P38634	284 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	RPP1	P38786	293 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	YAR028W	P39548	234 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	YIL165C	P40446	119 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	CHA4	P43634	648 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	PRM8	P53174	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	YGR016W	P53209	190 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	MAL12	P53341	584 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	RCE1	Q03530	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	CTS2	Q06350	511 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	HRT1	Q08273	121 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	UIP4	Q08926	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	SPC3	Q12133	184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	HMS1	Q12398	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MRPL39	YML009C	BPH1	P25356	2167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	CNA1	P23287	553 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	UBC8	P28263	218 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	DBF20	P32328	564 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
MRPL39	YML009C	MRPS5	P33759	307 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MLH1	P38920	769 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YER184C	P39961	794 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SPO73	P40031	143 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	GAT2	P40209	560 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YTA6	P40328	754 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	VHR1	P40522	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	NAS2	P40555	220 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SIP18	P50263	79 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SCY1	P53009	804 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	DMA2	P53924	522 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	ASI1	P54074	624 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	ABZ2	Q03266	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	API2	Q04413	109 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YLR126C	Q12288	251 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SPO24	Q3E752	67 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MSW1	P04803	379 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SNF4	P12904	322 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	POL4	P25615	582 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	PPG1	P32838	368 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MRPL6	P32904	214 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YKL187C	P34231	750 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SBE22	P38814	852 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	PIG2	P40187	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	GDS1	P41913	522 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	STB1	P42845	420 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	AGP3	P43548	558 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YDR239C	Q03780	787 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SPC19	Q03954	165 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RSM24	Q03976	319 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MIM1	Q08176	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	WSC3	Q12215	556 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RTN2	Q12443	393 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	PPA2	P28239	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	VPH2	P32341	215 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RPC82	P32349	654 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YME2	P32843	850 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SPC29	P33419	253 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MRPL16	P38064	232 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	RTC2	P38279	296 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	YER084W	P40057	128 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	SLZ1	P40167	298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	MPH1	P40562	993 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPL39	YML009C	IRC5	P43610	853 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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