RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	CGR1	P53188	120 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TRM82	Q03774	444 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SMP3	Q04174	516 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YLR173W	Q06247	608 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FRE8	Q12209	686 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RSR1	P13856	272 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	CKI1	P20485	582 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TPO5	P36029	618 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ATG7	P38862	630 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FHL1	P39521	936 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RRT13	P40042	185 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	GPN3	Q06543	272 aa		2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	VPS3	P23643	1011 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	CIN8	P27895	1000 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ACB1	P31787	87 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FMT1	P32785	401 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BUD2	P33314	1104 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RCK2	P38623	610 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RCY1	P39531	840 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FMC1	P40491	155 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	MRX5	P47007	382 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	COX16	P47081	118 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SUR7	P54003	302 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BOP2	Q06150	570 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	DDC1	Q08949	612 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YPR1	Q12458	312 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FMP16	Q12497	93 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SPO24	Q3E752	67 aa		2.31	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	MRPS5	P33759	307 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.3	□□□□□ -2.04	not detected
YCT1	YLL055W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	IST2	P38250	946 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	PEX32	P38292	413 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	FET3	P38993	636 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YNL320W	P42840	284 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	KEL2	P50090	882 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YGL185C	P53100	379 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	NAT4	Q04751	285 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BUR2	Q05949	395 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YLL007C	Q07799	665 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BTS1	Q12051	335 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SIA1	Q12212	622 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YOL107W	Q12239	342 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	PRM7	Q12459	698 aa		2.3	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RBK1	P25332	333 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	MXR2	P25566	168 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	CSM1	P25651	190 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ZIP1	P31111	875 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	MKK1	P32490	508 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TAE1	P38340	232 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	GGC1	P38988	300 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YGR168C	P53293	376 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YNL050C	P53952	270 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	UBX2	Q04228	584 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	API2	Q04413	109 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ALE1	Q08548	619 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TY3A-G	Q12173	290 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TY3A-I	Q99219	290 aa		2.29	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	DCC1	P25559	380 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	URA10	P30402	227 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	ITR2	P30606	609 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	DOA4	P32571	926 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	INA22	P40576	216 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	TAF6	P53040	516 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	KAP114	P53067	1004 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	GIM3	P53900	129 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SED5	Q01590	340 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SRL4	Q03085	281 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	SCS7	Q03529	384 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	CSM3	Q04659	317 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	GMC2	Q06201	188 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	AUS1	Q08409	1394 aa		2.28	□□□□□ -2.04
YCT1	YLL055W	QCR6	P00127	147 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	RAD7	P06779	565 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SUA5	P32579	426 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	MYO3	P36006	1272 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	HIS2	P38635	335 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	TDA11	P38854	504 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	FRT2	P39734	528 aa		2.27	□□□□□ -2.05
YCT1	YLL055W	SCC4	P40090	624 aa		2.27	□□□□□ -2.05

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.3 ms