RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIR3	YKL163W	POP5	P28005	173 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ITR2	P30606	609 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	AST1	P35183	429 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YKL162C	P36052	402 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RIM2	P38127	377 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PAC2	P39937	518 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YFL015C	P43578	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	AIM24	P47127	394 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	HMS2	P47175	358 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YPT11	P48559	417 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PMT5	P52867	743 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YGR067C	P53243	804 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	BIO4	P53630	237 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	CPR8	P53728	308 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PRM15	Q03262	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASA1	Q06822	443 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YOR338W	Q99326	363 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IMA3	P0CW40	589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IMA4	P0CW41	589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SPO12	P17123	173 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SNF6	P18888	332 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IRA1	P18963	3092 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RPB8	P20436	146 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	NUP1	P20676	1076 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PEX3	P28795	441 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SNC1	P31109	117 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	NUP2	P32499	720 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	VAM7	P32912	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	MRPS5	P33759	307 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RSM22	P36056	628 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YPK3	P38070	525 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	LEU5	P38702	357 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RBG1	P39729	369 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	COX15	P40086	486 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	COA1	P40452	197 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	NAS6	P50086	228 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PKP2	P53170	491 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	BUD32	P53323	261 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	MKC7	P53379	596 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	GPI15	P53961	229 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SED5	Q01590	340 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PRM6	Q04705	352 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IVY1	Q04934	453 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	DCR2	Q05924	578 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ATG17	Q06410	417 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RAD34	Q06665	692 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IMA2	Q08295	589 aa		3.74	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	BAR1	P12630	587 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	CTR86	P25355	563 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.73	□□□□□ -1.81	not detected
PIR3	YKL163W	TKL2	P33315	681 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SKT5	P34226	696 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	UTH1	P36135	365 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	MIC12	P38341	106 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	FAU1	P40099	211 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	TDA10	P42938	290 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	TAD2	P47058	250 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RPC17	P47076	161 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	GET1	P53192	235 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	GPI1	P53306	609 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SSK1	Q07084	712 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	MCH4	Q08268	501 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SGT1	Q08446	395 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	OSW1	Q08692	278 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	GPM2	Q12008	311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	SUC2	P00724	532 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	HTB2	P02294	131 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	HEM2	P05373	342 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	RAD1	P06777	1100 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	DCC1	P25559	380 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	POP7	P38291	140 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	TRM5	P38793	499 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ATG7	P38862	630 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	3.72	□□□□□ -1.81	RIP-Chip
PIR3	YKL163W	HAT2	P39984	401 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	ERG28	P40030	148 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	DDI1	P40087	428 aa		3.72	□□□□□ -1.81
PIR3	YKL163W	YIL060W	P40519	144 aa		3.72	□□□□□ -1.81

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