RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C PRP39P39682 629 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RRG9P40156 214 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C COS4P43542 379 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C HCH1P53834 153 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C INP1Q03694 420 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VTI1Q04338 217 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C GMC1Q04399 608 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SPH1Q06160 661 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YDL144CQ07589 356 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C APC2Q12440 853 aa2.02□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RPO31P04051 1460 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-DR3Q99231 1755 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CTA1P15202 515 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CPT1P17898 393 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DCC1P25559 380 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SRB2P34162 210 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RFT1P38206 574 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YMR262WP38430 313 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C BTT1P40314 149 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C IGO1P53897 168 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YNL146WP53906 100 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YMR244WQ04018 355 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DFM1Q12743 341 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PDR5P33302 1511 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VTH1P40438 1549 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VTH2P40890 1549 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY3B-GQ99315 1547 aa2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CAT8P39113 1433 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-FP0CX63 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-CP25384 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-DR2Q03494 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-DR1Q03855 1755 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-OR1Q12113 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-DR1Q12472 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-OR2Q12501 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SAL1D6W196 494 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DAL5P15365 543 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C ZRT3P34240 503 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C KTI12P34253 313 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SMF2P38778 549 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SPO73P40031 143 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YIL089WP40500 205 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YGL114WP53134 725 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RPN14P53196 417 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TPC1P53257 314 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY2B-BQ12491 1770 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C IQG1Q12280 1495 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SNF2P22082 1703 aa2□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C ARO1P08566 1588 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C REP1P03871 373 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CUP2P15315 225 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RBK1P25332 333 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VPH1P32563 840 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YEL043WP32618 956 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TCD1P38756 429 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YIL054WP40524 105 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DSN1P40568 576 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MIC19P43594 170 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C FMP48P53233 369 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PDR16P53860 351 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DIA1P54005 336 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C ECM19Q06011 112 aa1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MLP1Q02455 1875 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SPS100P13130 326 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RPB9P27999 122 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C ITR2P30606 609 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MEI5P32489 222 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SWI3P32591 825 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YKL187CP34231 750 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C BLI1P35727 113 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RTR1P40084 226 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MPP10P47083 593 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TAF6P53040 516 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C SDS23P53172 527 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PXR1P53335 271 aaPredicted RBP1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MRX9Q07349 420 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PSY3Q12318 242 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PRM4Q12498 284 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TRM3Q07527 1436 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DNF2Q12675 1612 aa1.98□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C GDB1Q06625 1536 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VMA5P31412 392 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RCK1P38622 512 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CTM1P38818 585 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DSE1P40077 573 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C RSM25P40496 264 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C PMT4P46971 762 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C ASG7P46993 209 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CAX4P53223 239 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C VPS60Q03390 229 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C BUR2Q05949 395 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C MIM1Q08176 113 aa1.97□□□□□ -2.09
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