RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A CAX4P53223 239 aa1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A YLR012CQ07927 99 aa1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A PML1Q07930 204 aaPredicted RBP1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A YDR262WQ12331 272 aa1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A TRM10Q12400 293 aa1.66□□□□□ -2.14
RPC10YHR143W-A SAL1D6W196 494 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A VPH1P32563 840 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MED8P38304 223 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ECM14P38836 430 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A LIN1P38852 340 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A DSE1P40077 573 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YGR016WP53209 190 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A BUR2Q05949 395 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SGT2Q12118 346 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A PSY3Q12318 242 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A TFC7Q12415 435 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A FAB1P34756 2278 aa1.65□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A RPS23BP0CX30 145 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SPS100P13130 326 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A DAL5P15365 543 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A HPR1P17629 752 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SMI1P32566 505 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A CSE1P33307 960 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ASP1P38986 381 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A BUD13P46947 266 aaPredicted RBP1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A FYV8P46949 817 aaKnown RBP1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A UBX2Q04228 584 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MIM1Q08176 113 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A HRT1Q08273 121 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YPL264CQ08980 353 aa1.64□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A VPH2P32341 215 aa1.63□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YDR222WQ04925 415 aa1.63□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A VIK1Q12045 647 aa1.63□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YPR063CQ12160 140 aa1.63□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A CBP2P03874 630 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A GAL3P13045 520 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ERD1P16151 362 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A TKL2P33315 681 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A PES4P39684 611 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A EDC2P40023 145 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A INA22P40576 216 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A HSH155P49955 971 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SHE4P51534 789 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YGR168CP53293 376 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YNR066CP53752 436 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YPL113CQ02961 396 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A IRC4Q03036 179 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YDR114CQ04597 100 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A GTO3Q04806 366 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ERP3Q12403 225 aa1.62□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A DAL81P21657 970 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ALK2P32789 676 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SUR1P33300 382 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A AIM29P36154 155 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SDH4P37298 181 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YHR035WP38769 630 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A PET8P38921 284 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SOP4P39543 234 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A NAS2P40555 220 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YFL040WP43562 540 aa1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A RLP24Q07915 199 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A CDC37P06101 506 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A IFM1P25038 676 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A UTR5P32630 166 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SMC2P38989 1170 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A CAJ1P39101 391 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A UTP25P40498 721 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ECO1P43605 281 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YFR045WP43617 309 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YGL088WP53151 121 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A OKP1P53298 406 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SNX41Q04053 625 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MGR3Q04472 501 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A SEC13Q04491 297 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A STE23Q06010 1027 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A UTP23Q12339 254 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A IES3Q12345 250 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A LAG2Q92325 660 aa1.6□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data1.59□□□□□ -2.15not detected
RPC10YHR143W-A RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MSS116P15424 664 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MIG1P27705 504 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A ZRT1P32804 376 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MRPL6P32904 214 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A PPQ1P32945 549 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A UFD1P53044 361 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A LIF1P53150 421 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YPL080CQ02826 108 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A DXO1Q06349 442 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A YOR292CQ08743 309 aa1.59□□□□□ -2.15
RPC10YHR143W-A MET2P08465 486 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YOL163WP0CF20 169 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A VMA2P16140 517 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
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